一种影响杜洛克猪眼肌面积性状的分子标记及应用.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN108728552A(43)申请公布日2018.11.02(21)申请号201810337360.9(22)申请日2018.04.16(71)申请人华南农业大学地址510642广东省广州市天河区五山路483号(72)发明人杨杰吴珍芳王兴旺全建平郑恩琴杨明杨化强蔡更元(74)专利代理机构广东广信君达律师事务所44329代理人杨晓松(51)Int.Cl.C12Q1/6888(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书4页序列表1页附图2页(54)发明名称一种影响杜洛克猪眼肌面积性状的分子标记及应用(57)摘要本发明属于分子标记辅助选择技术及动物遗传育种领域，公开了一种影响猪眼肌面积的SNP分子标记及其应用。所述SNP分子标记为猪基因组第6号染色体第35091111位碱基由A到G的位点突变，对应于SEQIDNO:1所示序列中的第214bp处(命名为：g.214T>G)。利用本发明的引物对，以猪基因组DNA为模板进行PCR扩增，可以得到与猪眼肌面积性状紧密连锁的SNP分子标记。本发明提供的分子遗传标记可以用于种猪的眼肌面积的筛选，能够有效提高猪的眼肌面积及肉质性状。CN108728552ACN108728552A权利要求书1/1页1.一种影响猪眼肌面积性状的分子标记，其特征在于：所述分子标记的核苷酸序列SEQIDNO:1所示，其中序列中的M是T或G，导致猪眼肌面积的不同。2.根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于：所述的分子标记的位点位于国际猪参考基因组11.1版本6号染色体上35091111bp处。3.一种用于检测权利要求1或2所述分子标记的引物对，其特征在于：所述引物对的核酸序列如下所示：上游引物如SEQIDNO：2所示；下游引物如SEQIDNO：3所示。4.权利要求1-3任一所述分子标记/引物对在猪的眼肌面积遗传育种中的应用。5.一种鉴定眼肌面积的方法，其特征在于：检测SEQIDNO:1序列的5’端第214bp是T还是G。6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：采用权利要求3所述的引物对进行检测。7.一种种猪的遗传改良方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：确定种猪核心群中种猪的权利要求1所述的分子标记，选择第214位核苷酸位点的TT型个体作为种猪；或者，种猪的继代选育国际猪参考基因组11.1版本6号染色体上35091111bp处的TT型个体，淘汰该点的GG型和GT型个体。8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于：所述的方法具体包括以下步骤：(1)提取待测猪的基因组DNA；(2)采用权利要求3所述的引物对，将所述待测猪的基因组DNA进行PCR扩增，以便获得PCR扩增产物；(3)对所述PCR扩增产物进行测序，以便获得测序结果；(4)基于所述测序结果，确定所述待测猪的如权利要求1或2所述的SNP分子标记的基因型，淘汰该位点的GG型和GT型个体，以逐代提高该位点的纯合基因型TT型的频率，从而提高眼肌产量。9.根据权利要求1-2、4-8任一所述分子标记/方法，其特征在于：所述的猪包括杜洛克猪及其合成系。2CN108728552A说明书1/4页一种影响杜洛克猪眼肌面积性状的分子标记及应用技术领域[0001]本发明属于分子标记辅助选择技术及动物遗传育种领域，特别涉及一种影响眼肌面积性状的分子标记及其应用。背景技术[0002]我国是世界上猪肉生产和猪肉消费的第一大国。近些年来，随着猪肉总量和人民生活水平的提高，人民对高品质的猪肉需求越来越高。眼肌也叫背最长肌，是猪全身最鲜嫩的肉，营养丰富，味美，易消化。眼肌就是高品质猪肉的代表。因此提高高品质猪肉产量成为新的育种目标，而眼肌面积作为影响猪肉品质的主要因素，成为猪育种计划的一部分。[0003]目前，利用基因组扫描法和候选基因法已经发现了与猪的眼肌面积性状显著相关的322个QTLs，分布在所有的染色体上。但是这两种方法还是有着自身无法克服的缺陷。QTL连锁分析的一致性检验会受到不同资源家系群体的影响，而且一个QTL的区域很大，往往包括上百个候选基因，要做到精细定位QTL同时找到更多的相邻连锁标记也比较困难，而在基因定位中，由于现用定位材料的局限性，常常存在定位不准确的问题，而且在数量性状基因座QTL定位的技术中，并不是所有的目标QTL都可以被检测出来，且QTL与环境存在互作、以及大效应的QTL对小效应的QTL的掩盖等问题。候选基因法必须选择功能已知的候选基因作为目标基因，基本不能鉴别出新的基因。GWAS是目前为止鉴定SNPs、候选基因或候选基因家族的一种更为有效的方法。眼肌面积性状与产肉性能有强相关关系，眼肌面积越大，饲料利用率与瘦肉率也越高。对于眼肌面积的选择可以促进其他的经济性状的提