用于猪亲缘关系鉴定的SNP分子标记组合、应用及方法.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN113981109A(43)申请公布日2022.01.28(21)申请号202111467074.2(22)申请日2021.12.03(71)申请人北京康普森农业科技有限公司地址102200北京市昌平区回龙观镇生命园路4号院4号楼7层701室(昌平示范园)(72)发明人刘继强(74)专利代理机构武汉仁合利泰专利代理事务所(特殊普通合伙)42275代理人别望望(51)Int.Cl.C12Q1/6888(2018.01)C12Q1/6869(2018.01)C12Q1/6837(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书6页说明书58页附图1页(54)发明名称用于猪亲缘关系鉴定的SNP分子标记组合、应用及方法(57)摘要本申请提供一种用于猪亲缘关系鉴定的SNP分子标记组合、应用及方法，SNP分子标记组合包括在猪的18条常染色体上的200个SNP标记，该SNP分子标记组合能够应用在杜洛克猪、长白猪和大白猪的亲缘关系鉴定中，鉴定方法包括制备上述200个SNP标记的液相芯片；利用待测猪基因组DNA构建高通量测序文库；将液相芯片与高通量测序文库混合，捕获猪DNA高通量测序文库中包含目标SNP位点的DNA片段并进行扩增和纯化，获得待测猪个体的基因分型，根据基因分型进行亲子鉴定推断。本发明提供了鉴定SNP位点信息的探针及试剂盒。本发明通过靶向捕获测序检测SNP多态性，经高深度测序，分型结果准确可靠，保证了亲子关系的精准性。CN113981109ACN113981109A权利要求书1/6页1.一种用于猪亲缘关系鉴定的SNP分子标记组合，其特征在于，包括：在猪的18条常染色体上的200个SNP标记，所述SNP标记的SNP位点信息如下：编号1的SNP位点位于2号染色体上第9987664位；编号2的SNP位点位于14号染色体上第418001位；编号3的SNP位点位于15号染色体上第2977317位；编号4的SNP位点位于7号染色体上第7738134位；编号5的SNP位点位于10号染色体上第2775295位；编号6的SNP位点位于3号染色体上第11913946位；编号7的SNP位点位于9号染色体上第7629826位；编号8的SNP位点位于4号染色体上第7720753位；编号9的SNP位点位于16号染色体上第2857298位；编号10的SNP位点位于8号染色体上第1653890位；编号11的SNP位点位于5号染色体上第5646887位；编号12的SNP位点位于6号染色体上第2308923位；编号13的SNP位点位于17号染色体上第2842639位；编号14的SNP位点位于12号染色体上第1779292位；编号15的SNP位点位于11号染色体上第4655543位；编号16的SNP位点位于13号染色体上第7406226位；编号17的SNP位点位于18号染色体上第23529836位；编号18的SNP位点位于1号染色体上第1166570位；编号19的SNP位点位于8号染色体上第1735070位；编号20的SNP位点位于15号染色体上第126780202位；编号21的SNP位点位于13号染色体上第9797897位；编号22的SNP位点位于1号染色体上第277024546位；编号23的SNP位点位于12号染色体上第9778935位；编号24的SNP位点位于6号染色体上第10774932位；编号25的SNP位点位于9号染色体上第60564642位；编号26的SNP位点位于6号染色体上第11560736位；编号27的SNP位点位于17号染色体上第13605151位；编号28的SNP位点位于2号染色体上第10411684位；编号29的SNP位点位于6号染色体上第11229072位；编号30的SNP位点位于4号染色体上第15870194位；编号31的SNP位点位于17号染色体上第13261924位；编号32的SNP位点位于12号染色体上第9585887位；编号33的SNP位点位于8号染色体上第11917230位；编号34的SNP位点位于1号染色体上第3659113位；编号35的SNP位点位于1号染色体上第13677911位；编号36的SNP位点位于2号染色体上第45279469位；编号37的SNP位点位于16号染色体上第75677205位；2CN113981109A权利要求书2/6页编号38的SNP位点位于14号染色体上第1472814位；编号39的SNP位点位于17号染色体上第35417485位；编号40的SNP位点位于5号染色体上第89085559位；编号41的SNP位点位于6号染色体上第110566592位；编号42的SNP位点位于5号染色体上第26784434位；编号4