水稻稻瘟病抗性基因Pid4的KASP标记开发及其应用.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN114164292A(43)申请公布日2022.03.11(21)申请号202111336313.0(22)申请日2021.11.12(71)申请人江苏省农业科学院宿迁农科所地址223831江苏省宿迁市宿城区埠子镇肖桥村叶圩组(72)发明人陈春郭新亚陈卫军(74)专利代理机构上海怡恩专利代理事务所(普通合伙)31336代理人牟俊玲(51)Int.Cl.C12Q1/6895(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书2页说明书8页序列表1页附图1页(54)发明名称水稻稻瘟病抗性基因Pid4的KASP标记开发及其应用(57)摘要本发明公开了水稻稻瘟病抗性基因Pid4的KASP标记开发及其应用，属于基因生物技术领域。其中所述分子标记是与水稻稻瘟病抗性基因Pid4紧密连锁的KASP标记KASP_Pid4，所述KASP_Pid4是水稻基因组中的一个InDel位点，其核苷酸种类为+或‑，为序列表中SEQIDNo.4的第101位核苷酸。本发明应用KASP技术对水稻稻瘟病抗性基因Pid4进行基因型鉴定，具有操作简便、成本低廉、检测周期短、标记稳定、绿色环保等优点，可精准检测水稻稻瘟病抗性基因Pid4，对促进水稻抗病育种具有重要意义。CN114164292ACN114164292A权利要求书1/2页1.水稻稻瘟病抗性基因Pid4的KASP标记开发，其特征在于：所述分子标记是与水稻稻瘟病抗性基因Pid4紧密连锁的KASP标记KASP_Pid4，所述KASP_Pid4是水稻基因组中的一个InDel位点，其核苷酸种类为+或‑，为序列表中SEQIDNo.4的第101位核苷酸。2.根据权利要求1所述的水稻稻瘟病抗性基因Pid4的KASP标记开发的应用，其特征在于：所述与水稻稻瘟病抗性基因Pid4紧密连锁的KASP分子标记在C1、C2、C3或C4中的应用；所述C1为检测水稻基因组中KASP_Pid4位点的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定水稻稻瘟病抗性中的应用；所述C2为检测水稻基因组中KASP_Pid4位点的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定抗稻瘟病水稻产品中的应用；所述C3为检测水稻基因组中KASP_Pid4位点的多态性或基因型的物质在水稻辅助育种或制备水稻辅助育种产品中的应用；所述C4为检测水稻基因组中KASP_Pid4位点的多态性或基因型的物质在选育抗稻瘟病水稻资源中的应用。3.根据权利要求1所述的水稻稻瘟病抗性基因Pid4的KASP标记开发的应用，其特征在于：还提供一种鉴定或辅助鉴定水稻稻瘟病抗性的方法，包括检测待测水稻的基因型，根据待测水稻的基因型鉴定或辅助鉴定水稻稻瘟病抗性；所述基因型为水稻基因组中KASP_Pid4位点的基因型；所述记KASP_Pid4位点是水稻基因组中的一个InDel位点，其核苷酸种类为+或‑，为序列表中SEQIDNo.4的第101位核苷酸；其中，所述KASP_Pid4位点的基因型为++基因型时，水稻为感稻瘟病或者候选为感稻瘟病；所述KASP_Pid4位点的基因型为‑‑基因型或者+‑基因型时，水稻为抗稻瘟病或者候选为抗稻瘟病；其中，所述++基因型表示水稻基因组中所述KASP_Pid4位点的核苷酸种类为+的纯合型；所述‑‑基因型表示水稻基因组中所述KASP_Pid4位点的核苷酸种类为‑的纯合型；所述+‑基因型表示水稻基因组中所述KASP_Pid4位点的核苷酸种类为+和‑的杂合型。4.根据权利要求3所述的水稻稻瘟病抗性基因Pid4的KASP标记开发的应用，其特征在于：所述检测水稻基因组中KASP_Pid4位点的多态性或基因型的物质在A1、A2、A3或A4中的应用；所述A1为检测水稻基因组中KASP_Pid4位点的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定抗稻瘟病水稻中的应用；所述A2为检测水稻基因组中KASP_Pid4位点的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定抗稻瘟病水稻产品中的应用；所述A3为检测水稻基因组中KASP_Pid4位点的多态性或基因型的物质在水稻辅助育种或制备水稻辅助育种产品中的应用；所述A4为检测水稻基因组中KASP_Pid4位点的多态性或基因型的物质在选育抗稻瘟病水稻资源中的应用。5.根据权利要求1所述的水稻稻瘟病抗性基因Pid4的KASP标记开发的应用，其特征在于：还提供一种选育抗稻瘟病水稻资源的方法，包括选择KASP_Pid4位点的基因型‑‑或基因型为+‑的水稻进行育种，其中，所述KASP_Pid4位点是水稻基因组中的一个InDel位点，其核苷酸种类为+或‑，为序列表中SEQIDNo.4的第101位核苷酸；所述‑‑基因型表示水稻基因组中所述KASP_Pid4位点的核苷酸种类为‑的纯合型；所述+‑基因型表