一种与鸡的腹脂重性状相关的分子标记及其应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN115851962A(43)申请公布日2023.03.28(21)申请号202210790399.2(22)申请日2022.07.06(71)申请人中国农业科学院北京畜牧兽医研究所地址100193北京市海淀区圆明园西路2号(72)发明人赵桂苹文杰崔焕先朱雨婷刘丽(74)专利代理机构北京市诚辉律师事务所11430专利代理师范盈(51)Int.Cl.C12Q1/6888(2018.01)C12Q1/6858(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书6页序列表（电子公布）附图2页(54)发明名称一种与鸡的腹脂重性状相关的分子标记及其应用(57)摘要本发明公开了一种与鸡的腹脂重性状相关的分子标记及其应用，属于分子育种技术领域。该SNP分子标记对应于NCBI中公布的鸡参考基因组Gallus_gallus6.0版本序列信息11号染色体第18,362,638位，此处碱基为G/A，GG基因型个体的腹脂重显著小于AA基因型个体。使用该分子标记进行标记辅助选择，能够降低鸡腹脂的沉积，节省生产成本并加快遗传进展。利用本发明分子标记构建的检测方法，成本低、操作简便，具有重要的实际应用价值。CN115851962ACN115851962A权利要求书1/1页1.一种与鸡的腹脂重性状相关的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记序列为ACACATCAGATTTCAATCTCG/AGCAGCCATGGGATCATTTTC，对应于NCBI中公布的鸡参考基因组Gallus_gallus‑6.0版本序列信息11号染色体，其中第18,362,638位的碱基为G或A，基因型为GG、GA、AA；GG基因型腹脂重低于GA型和AA基因型。2.一种检测权利要求1所述的与鸡腹脂重性状相关的SNP分子标记的引物，其特征在于，包括：上游引物F：ATGCTCACCTGGAATAACCCC；下游引物R：GCGCAGATAAGATGGCAGGTA。3.一种权利要求2所述的引物在检测鸡的腹脂重性状或制备检测鸡的腹脂性状的试剂盒中的应用，其特征包括权利要求2中的引物。4.一种检测鸡腹脂重性状的方法，其特征在于，检测待测样本鸡中如权利要求1所述的SNP分子标记的基因型。5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，包括如下步骤：(1)提取待测鸡的基因组DNA；(2)检测待测鸡11号染色体第18,362,638位SNP分子标记的基因型；(3)利用权利要求2所述的引物进行PCR扩增，获取扩增产物；(3)直接测序法对获得的PCR扩增产物进行等位基因测序；(4)基于所述测序结果，确定待测鸡如权利要求1所述的SNP标记的基因型。6.权利要求1所述SNP分子标记在鉴定鸡腹脂重基因型并应用于低腹脂鸡育种中的应用。7.如权利要求6所述的应用，其特征在于，检测鸡国际参考基因组6.0版本11号染色体上chr11:18362638的基因型,表明携带GG基因型的个体具有较低的腹脂沉积。8.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，步骤(1)中所述提取待测鸡的基因组DNA的方法为：对待测鸡进行鸡翅静脉采血，用抗凝剂进行抗凝处理后经裂解、蛋白酶消化处理，然后采用酚仿法提取基因组DNA，以ddH2O溶解。9.一种权利要求1所述的SNP分子标记和\或权利要求2所述的引物在鸡育种中的应用。2CN115851962A说明书1/6页一种与鸡的腹脂重性状相关的分子标记及其应用技术领域[0001]本发明属于基因检测技术领域，具体涉及一种与鸡的腹脂重性状相关的分子标记及其应用。背景技术[0002]随着肉鸡行业的快速发展和集约化选择，导致肉鸡体内脂肪(尤其是腹部脂肪)过度沉积。而肉鸡腹部脂肪沉积过多会对胴体产量、饲料转化率、生育率和孵化率等产生不利影响。这些问题是造成全球肉鸡生产者遭受重大经济损失的原因。因此控制鸡腹部脂肪沉积，是肉鸡育种者们的主要目标之一。然而，由于鸡腹部脂肪测量的复杂性，大大阻碍基于腹部脂肪测量的遗传改良，因此在这种情况下，分子标记辅助选择(MAS)是提高选择效率的有效方法，用于促进生产低腹脂的鸡。[0003]肉鸡的腹脂是一个高遗传力的性状，腹脂遗传力在0.50‑0.80，表明遗传选择能有效减少肉鸡腹脂过度沉积。目前对肉鸡的腹脂含量采用直接选择育种已经取得了一定的进展，而通过分子标记手段从遗传上可进一步降低肉鸡的腹脂沉积。与腹脂重相关的遗传变异可以用遗传标记进行关联，通过对标记的选择而同时改善肉鸡的腹脂沉积。全基因组关联分析是鉴定表型和基因型之间遗传联系的最主要手段之一。为鉴定表型和基因型之间的遗传联系，便于对腹脂重进行早期选择，节省生产成本并加快遗传进展，更好地服务于鸡的育种。因此，与肉鸡腹脂重性状相关的分子标记的研究具有重