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本发明公开了一种与黄羽肉鸡腹脂性状相关的分子标记及其应用。所述分子标记的核苷酸序列如SEQIDNO:1所示,所述分子标记的突变位于其启动子NC_006088.5:g.11372123G>A处。本发明发现由于CD36基因启动子区域突变影响黄羽肉鸡的腹脂性状。因此,所述分子标记可应用于选育腹脂沉积比较少的个体,包括如下步骤:S1.提取待检测黄羽肉鸡的DNA;S2.目的片段的获得及测序:利用正反向引物对通过PCR扩增待测鸡的DNA,将获得的产物进行测序,分析序列碱基;S3.根据分析结果,育种时选择保留判定为AA基因型的个体。所述分子标记有利于选育优势纯合基因型黄羽肉鸡,减少鸡的腹脂沉积。