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本发明公开了一种益母草碱、黄精多糖和脱氧野尻霉素药物组合物及其应用,该药物组合物包括重量比为1.5~2:1:10~16的益母草碱、黄精多糖和脱氧野尻霉素。经药理实验证明该组合物能有效降低血糖同时有效抑制血栓,可用于制备糖尿病基础病合并血栓治疗药物,具有组方简单、活性成分含量高、安全有效等优点。