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本发明提出一种基于多模态融合的肿瘤分类方法和系统,包括:根据来自同一位用户的多模态影像构建多模态图,多模态图中顶点为该多模态影像中单帧影像,多模态图中边为模态相异的顶点间的匹配边;使用肿瘤分类模型对多模态图中所有匹配边进行特征的提取和融合,得到每条边的置信度;根据每条边的置信度,选择并构建出一个可信边集合,将可信边集的置信度和该用户的临床信息进行加权融合,得到该多模态影像建图的肿瘤识别结果。由此能够结合用户不同模态的影像数据,进行肿瘤高精度分类。