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本申请提供一种基于病毒载体的RNA递送系统及其应用。其中,该RNA递送系统包括病毒载体,所述病毒载体携带有所需递送的RNA片段,所述病毒载体能够在宿主的器官组织中富集,并在所述宿主器官组织中内源性地自发形成含有所述RNA片段的复合结构,所述复合结构能够进入并结合目标组织,将所述RNA片段送入目标组织。本申请提供的基于病毒载体的RNA递送系统安全性和可靠性已被充分验证,成药性非常好、通用性强,具有极好的经济效益和应用前景。