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本发明公开了蛋白质ZMCPK6及其编码基因与应用。蛋白质ZMCPK6的氨基酸序列如SEQIDNO:1所示。向玉米自交系B73中导入ZMCPK6基因,得到转ZMCPK6基因玉米。实验证明,与玉米自交系B73相比,转ZMCPK6基因玉米的抗旱性降低。由此可见,蛋白质ZMCPK6可以调控玉米的抗旱性,本发明具有重要的应用价值。