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本发明公开了玉米抗盐碱蛋白质及其编码基因与应用。本发明公开的玉米抗盐碱蛋白质为氨基酸序列是序列2的蛋白质;其编码基因为序列表中序列1所示的DNA分子,在玉米中的基因组序列为序列表中序列3。本发明的实验证明,玉米抗盐碱蛋白质的编码基因过表达后表现出显著的盐碱胁迫耐受性。从而证明,本发明的玉米抗盐碱蛋白质及其编码基因可以提高植物对高盐碱的耐逆性。