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本发明公开了一种检测人芽囊原虫的核酸组合物及其试剂盒和应用,涉及生物检测技术领域。本发明提供了一种检测人芽囊原虫的引物对,序列如SEQIDNo.1~2所示。通过该引物对对人芽囊原虫进行检测,能够缩短反应时间、减少对精密仪器的依赖性,简便快速地对人芽囊原虫进行分子生物学诊断,且检测灵敏度高、特异性强。对卫生防疫单位,特别是缺乏专业操作人员及相关精密仪器的基层卫生单位有良好的应用价值,并且带来一定的经济效益和社会效益。