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第四章酶TheapplicationofenzymehasamuchlongerhistorythanthatofenzymaticresearchSeeatp319第一节酶学概论一、酶概念及其作用特点酶是一类含有高效率、高度专一性、活性可调整生物催化剂。生物催化剂:酶(enzyme)核酶(ribozyme)脱氧核酶(deoxyribozyme)1、酶与非生物催化剂相比几点共性:①催化效率高,用量少(细胞中含量低)。②加紧反应速度但不改改变学反应平衡点。③降低反应活化能。④反应前后本身结构不变。催化剂改变了化学反应路径,使反应经过一条活化能比原路径低路径进行。催化剂效应只反应在动力学上(反应速度),不影响反应热力学(化学平衡)。3、酶催化反应特点(1)、催化效率更高酶催化反应速度是对应无催化反应108-1020倍,而且高出非酶催化反应速度最少几个数量级。★转换数(TN)或催化常数(Kcat)表示酶最大催化效率Kcat是一定条件下([S]》Km)每秒钟每个酶分子转换底物分子数(数值上Kcat=K3)(2).专一性高酶对反应底物和产物都有极高专一性,几乎没有副反应发生。(3)、易失活——反应条件温和常温、常压,中性pH环境。二、酶化学本质及其组成(一)酶化学本质绝大多数酶是蛋白质证据(1)酸水解产物是氨基酸,能被蛋白酶水解失活;(2)含有蛋白质一切共性,凡是能使蛋白质变性原因都能使酶变性;(含有蛋白质颜色反应)少数酶是RNA(核酶)★ribozyme核酶(含有催化功效RNA)(1)80年代初,ThomasCech和SidneyAltman四膜虫L19RNA含有生物催化功效,催化rRNA前体剪接(2)1983年Atman和PaceE.ColiRNaseP中RNA含有加工tRNA前体催化功效(二)酶化学组成单纯酶类(simpleenzyme):仅由蛋白质组成脲酶、溶菌酶、淀粉酶、脂肪酶、核糖核酸酶等缀合酶类(conjugatedenzyme):全酶(holoenzyme)=脱辅基酶(apoenzye)+辅因子(cofactor):超氧化物歧化酶Cu2+、Zn2+)、乳酸脱氢酶(NAD+)★酶辅助因子主要有金属离子和有机化合物金属离子:Fe2+、Fe3+、Zn2+、Cu+、Cu2+、Mn2+、、Mn3+、Mg2+、K+、Na+、Mo6+、Co2+等。有机化合物:NAD,NADP,FAD,生物素,卟啉等辅酶(coenzyme):与酶蛋白结合较松,可透析除去。辅基(prostheticgroup):与酶蛋白结合较紧。P324表8-4金属离子作为一些酶辅助因子P325表8-5基团转移反应中辅酶和辅基。(三)、单体酶、寡聚酶、多酶复合体、多酶融合体1、单体酶由一条或多条共价相连肽链组成酶分子牛胰RNase124a.a单链鸡卵清溶菌酶129a.a单链胰凝乳蛋白酶三条肽链2、寡聚酶①含相同亚基寡聚酶:苹果脱胱氢酶(鼠肝),2个相同亚基②含不一样亚基寡聚酶:琥珀酸脱氢酶(牛心),αβ2个亚基寡聚酶中亚基聚合,有与酶专一性相关,有与酶活性中心形成相关,有与酶调整性能相关。★大多数寡聚酶是胞内酶,而胞外酶普通是单体酶。3、多酶复合体★由两个或两个以上酶,靠非共价键结合而成,其中每一个酶催化一个反应,全部反应依次进行,组成一个代谢路径或代谢路径一部分。大肠杆菌丙酮酸脱氢酶复合体由三种酶组成:①丙酮酸脱氢酶(E1)以二聚体存在2×9600②二氢硫辛酸转乙酰基酶(E2)70000③二氢硫辛酸脱氢酶(E3)以二聚体存在2×5600012个E1二聚体24×9600024个E2单体24×700006个E3二聚体12×56000总分子量:560万4、多酶融合体(多功效酶)★一条多肽链上含有两种或两种以上催化活性酶,往往是基因融合产物。比如:天冬氨酸激酶I---高丝氨酸脱氢酶I融合体(双功效酶)该酶是四聚体α4,每条肽链含两个活性区域:N-端区域是Asp激酶,C端区域是高Ser脱氢酶三、酶分类及命名(一)、习惯命名1.依据底物来命名(绝大多数酶):蛋白酶、淀粉酶2.依据催化反应性质命名:水解酶、转氨酶3结合上述两个标准命名:琥珀酸脱氢酶。4.有时加上酶起源胃蛋白酶、牛胰凝乳蛋白酶(二)、国际系统命名★★基本标准:明确标明酶底物及催化反应性质(底物为水时可略去不写)。★P327表8-8酶国际系统命名法举例★★(三)国际系统分类法及编号(EC编号)(1)按反应性质分六大类,用1、2、3、4、5、6表示。(2)依据底物中被作用基团或键特点,将每一大类分为若干个亚类,编号用1、2、3。(3)每个亚类又可分为若干个亚一亚类,用编号1、2、3表示。每一个酶编号由4个数字组成,中间以“·”隔开。第一个数字表示大类,第二个数字表示亚类,第三个表示亚-亚类,第四个数字表示在亚-亚中编号。