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本发明属于医学样本分拣领域,具体涉及一种医学样本智能分拣系统,用于分拣采样管,包括:排料机构;输送机构;扫码装置;分拣机构;控制器和姿态调节机构,姿态调节机构位于所述排料辊内,所述姿态调节机构被装配为能够驱动所述采样管旋转至预设姿态,以使所述采样管落入所述输送机构上时,所述采样管上的识别码能够朝向上方。本发明在排料的同时,利用采样管在排料辊内的滚动调节采样管的姿态,使所有采样管上的标签都朝向指定方向,以便于后续进行扫码操作,采样管的姿态调节是在输送过程中完成的,不需要对每个采样管进行单独抓取和旋转,提高了系统工作效率,简化了设备结构,降低了设备成本。