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问题出发第二代测序数据分析原理2024/2/82024/2/82024/2/82024/2/8概要2024/2/82024/2/82024/2/82024/2/82024/2/82024/2/82024/2/82024/2/82024/2/82024/2/82024/2/82024/2/82024/2/8SecondgenerationsequenceExperimentsSequencingGlossary全基因组denove分析工具分析所需工具外显子组分析工具常规分析UniGene拼接3.数据库注释UniGene表达分析UniGene表达差异分析组间差异基因上调与下调个数统计,可以通过此图观察上调与下调的一个总体趋势差异基因火山图,可以观察到差异基因总体分布GO功能分类KEGG代谢通路分析IPApathwayanalysis(http://www.ingenuity.com/)COG注释SSR重复序列注释LncRNA预测RSAM‐01:模式动植物基因组数据和注释信息整合RSAM‐07:可变剪接分析RSAM‐08:转录起始位点(TSS)分析RSAM‐09.融合基因的发现(FusiongeneDiscovery)RSAM‐10.非长编码RNA与多外显子反义转录本的识别RSAM‐11.结构变异SNV识别与计算按照研究需求选择