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第二代测序数据分析原理ppt课件.ppt

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问题出发第二代测序数据分析原理三代DNA测序技术之比较第一代测序技术：Sanger测序法——简便、快速逐渐被遗忘的测序技术：Maxam-Gilbert的DNA化学降解法Sanger测序的局限概要第二代测序技术454SOLIDIllumina其他第二代测序技术的共同点第二代测序技术的局限第三代测序技术：单分子测序直接测序法SecondgenerationsequenceExperimentsSequencingGlossary2526 全基因组denove分析工具分析所需工具外显子组分析工具常规分析35UniGene拼接373.数据库注释39UniGene表达分析UniGene表达差异分析组间差异基因上调与下调个数统计，可以通过此图观察上调与下调的一个总体趋势差异基因火山图，可以观察到差异基因总体分布GO功能分类48495051KEGG代谢通路分析53IPApathwayanalysis()COG注释56SSR重复序列注释LncRNA预测RSAM‐01：模式动植物基因组数据和注释信息整合RSAM‐07：可变剪接分析RSAM‐08：转录起始位点（TSS）分析RSAM‐09.融合基因的发现（FusiongeneDiscovery）RSAM‐10.非长编码RNA与多外显子反义转录本的识别RSAM‐11.结构变异SNV识别与计算按照研究需求选择此课件下载可自行编辑修改，供参考！ 感谢您的支持，我们努力做得更好！