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第十八章基因诊疗与基因治疗(genediagnosisandtherapy)本章讨论二大方面内容一.基因诊疗概念:利用当代分子生物学和分子遗传学技术方法,直接检测基因结构及其表示水平是否异常,从而对疾病作出诊疗方法。二.基因诊疗特点:针对性强,特异性高检测灵敏度和准确性高实用性强,诊疗范围广三.基因诊疗惯用技术方法(一)核酸分子杂交技术核酸分子杂交是指单链核酸分子(DNA或RNA)在特定条件下,与另一条互补特异核酸链形成稳定双链过程。主要依据:碱基互补、变性和复性DNA与DNA杂交:A=T、G≡C;DNA与RNA杂交:A=U、G≡C;变性:在一定温度下,使核酸双链解开为两条单链;复性:随温度逐步恢复,变性两条单链重新形成互补双链hybridization利用核酸双链碱基互补、变性和复性原理,能够用已知碱基序列单链核酸片段作为探针,与待测样本中单链核酸互补配对,以判断有没有互补同源核酸序列存在。核酸探针是指带有标识某一特定DNA或RNA片断,能与待测样本中单链核酸分子互补配对结合,进而检测同源序列。探针标识物有放射性核素或非放射性核素(生物素、地高辛、荧光素等)两大类。1.核酸分子杂交分类液相杂交:待测核酸样本与特异性探针同时溶于杂交液中进行杂交反应;固相杂交:待测核酸样本先结合到固相支持物上,再与溶液中特异性探针进行杂交反应。惯用固相杂交支持物:硝酸纤维素膜、尼龙膜等---2.核酸分子杂交(固相杂交)操作程序3.惯用固相核酸杂交方法Southern印迹杂交法(Southernblotting)Northern印迹杂交法(Northernblotting)斑点杂交或狭缝杂交法(Spot/Slotblothybridization)菌落杂交(colonyhybridization)夹心杂交法(sanwichhybridization)原位杂交(nucleicacidhybridizationinsitu)(1)Southern印迹杂交法(Southernblotting)(2)Northern印迹杂交法(Northernblotting)(其基本过程类似于上述Southern法)提取RNA样本→RNA变性→琼脂糖凝胶电泳分离→转移至膜→探针(标识DNA或RNA)与之杂交→显影或显色→检测信号。Northern法可用于检测组织细胞中总RNA或mRNA(3)斑点杂交或狭缝杂交法:基本过程:将变性DNA或RNA直接点到固相支持滤膜上→用标识探针与之杂交→自显影或显色反应→检测杂交信号→分析结果。优点:简便、快速、灵敏、样本用量少;缺点:特异性不高,有一定百分比假阳性。(4)菌落杂交(colonyhybridization)(5)夹心杂交法(sanwichhybridization)(6)原位杂交(nucleicacidhybridizationinsitu)将标识探针与细胞或组织切片中核酸进行杂交,进而检测特异DNA或RNA序列。细胞原位杂交组织切片原位杂交DNA-DNARNA-DNA三类杂交RNA-RNA该法优点:不需提取核酸,故可完整保持组织或细胞形态,因而更能准确地反应组织细胞功效状态。(二)聚合酶链反应(PCR,polymerasechainreaction)技术(1)DNA模板变性将待扩增DNA加热到950C左右,使双链DNA解开成为单链(即:使模板DNA或延伸后双链DNA发生热变性),并游离于反应体系中作为模板;(2)模板与引物结合(退火或复性)将体系温度降至适当温度(550C左右),使加入引物与模板DNA两端(3ˊ端)碱基序列互补结合。(因为加入引物量远多于模板量,所以引物与模板结合百分比远大于模板本身复性);(3)引物延伸将体系温度升到720C左右,Taq聚合酶催化dNTP按碱基互补标准连接在DNA引物3ˊ端,使引物延伸,形成两条与模板互补新链。以上为一次PCR循环(变性、复性和延伸)(新合成链可作为下一轮循环模板)按照上述步骤重复操作,PCR产物呈指数扩增。模板DNA扩增倍数T=2n(n:循环次数)。PCR技术原理示意图2.PCR各要素及其作用(1)模板PCR模板能够是DNA或RNA。以线性DNA模板为佳,量适中,普通为102105个拷贝;RNA作为模板时,需要:RNAcDNAPCR,称此为RT-PCR.(2)耐热DNA聚合酶(TaqDNA聚合酶)是从耐热细菌体内提取一个DNA聚合酶,可在95℃稳定30分钟。从而确保PCR在[94℃变性→55℃退火→71℃延伸]循环30次过程中不变性失活。在PCR中,TaqDNA聚合酶应用最广泛。(3)引物引物是依据已知序列模板DNA待扩增区两端而设计一对寡核苷酸小片断,长度普通为1530个碱基。引物是确保PCR扩增产物大小和特异性关键原因,其设计与合成对PCR成功至关主要。引物设