DMD基因捕获探针及其在DMD基因突变检测中的应用.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN106834507A(43)申请公布日2017.06.13(21)申请号201710156540.2(22)申请日2017.03.16(71)申请人北京迈博恒业科技有限责任公司地址101300北京市顺义区南彩镇彩达三街1号茂华工场7号厂房4层402(72)发明人伍建林朋(74)专利代理机构北京纪凯知识产权代理有限公司11245代理人关畅(51)Int.Cl.C12Q1/68(2006.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书2页说明书10页附图12页(54)发明名称DMD基因捕获探针及其在DMD基因突变检测中的应用(57)摘要本发明公开了DMD基因捕获探针及其在DMD基因突变检测中的应用。本发明公开的DMD基因捕获探针的制备方法包括：制备N个亚探针，连接N个亚探针，得到DMD基因捕获探针；N为大于等于2的一个自然数；N个亚探针满足N个亚探针能覆盖DMD基因的全部序列；在DMD基因上任何两个相邻的亚探针均满足上游亚探针的下游有一个或多个核苷酸与下游亚探针的上游重叠；N个亚探针的长度均为50-150bp。利用本发明的DMD基因捕获探针对DMD基因进行检测不仅可以检测DMD基因是否存在缺失/重复扩增突变，还可以精确定位断裂点区域以及片段大小，还可以检测待测样本的DMD基因点突变。CN106834507ACN106834507A权利要求书1/2页1.DMD基因捕获探针，所述捕获探针的制备方法包括：制备N个亚探针，连接所述N个亚探针，得到DMD基因捕获探针；N为大于等于2的一个自然数；所述N个亚探针满足所述N个亚探针能覆盖所述DMD基因的全部序列。2.根据权利要求1所述的DMD基因捕获探针，其特征在于：在所述DMD基因上任何两个相邻的亚探针均满足上游亚探针的下游有一个或多个核苷酸与下游亚探针的上游重叠。3.根据权利要求1或2所述的DMD基因捕获探针，其特征在于：所述N个亚探针的长度均为50-150bp。4.根据权利要求1-3中任一所述的DMD基因捕获探针，其特征在于：所述N个亚探针的长度均为60bp。5.根据权利要求1-4中任一所述的DMD基因捕获探针，其特征在于：所述N个亚探针的序列均满足：第1条亚探针的序列为DMD基因的第1-60位；第2条亚探针的序列为DMD基因的第58-117位；第3条亚探针的序列为DMD基因的第115-174位；……第n条亚探针的序列为DMD基因的第【57(n-1)+1】-【57(n-1)+60】位；……第38953条亚探针的序列为DMD基因的第2220265-2220324位；第38954条亚探针的序列为DMD基因的第2220322-2220381位；其中，n为1-38954中的任一个自然数。6.权利要求1-5中任一所述的N个亚探针。7.DMD基因突变检测系统，包括权利要求1-5中任一所述的DMD基因捕获探针或所述的N个亚探针。8.权利要求1-5中任一所述捕获探针的制备方法。9.DMD基因突变检测方法，包括利用权利要求1-5中任一所述DMD基因捕获探针捕获待测样本的DMD基因，然后对捕获的DMD基因进行测序，确定所述待测样本的DMD基因的突变。10.下述任一应用：X1、权利要求1-5中任一所述DMD基因捕获探针或所述N个探针在检测DMD基因突变中的应用；X2、权利要求1-5中任一所述DMD基因捕获探针或所述N个探针在制备检测DMD基因突变产品中的应用；X3、权利要求1-5中任一所述DMD基因捕获探针或所述N个探针在诊断或辅助诊断假肥大型肌营养不良综合征中的应用；X4、权利要求1-5中任一所述DMD基因捕获探针或所述N个探针在制备诊断或辅助诊断假肥大型肌营养不良综合征产品中的应用；X5、权利要求7所述系统在检测DMD基因突变中的应用；X6、权利要求7所述系统在制备检测DMD基因突变产品中的应用；X7、权利要求7所述系统在诊断或辅助诊断假肥大型肌营养不良综合征中的应用；X8、权利要求7所述系统在制备诊断或辅助诊断假肥大型肌营养不良综合征产品中的2CN106834507A权利要求书2/2页应用；X9、权利要求9所述方法在诊断或辅助诊断假肥大型肌营养不良综合征中的应用。3CN106834507A说明书1/10页DMD基因捕获探针及其在DMD基因突变检测中的应用技术领域[0001]本发明涉及生物技术领域中，DMD基因捕获探针及其在DMD基因突变检测中的应用。背景技术[0002]DMD基因是假肥大型肌营养不良综合征致病基因(DMD/BMD)，位于X染色体Xp21.2区域，是目前已知的最大的人类基因，含有79个外显子，基因突变概率较高，在新生儿男婴中达到约1:3500。DMD基因含有多种突变类型，单个或多个外显子缺失突变最为常见，约占