SSR分子标记的发展及其在动植物遗传育种中的应用.pdf

贵州农业科学2006,34(增刊):93～95
GuizhouAgriculturalSciences

专论与综述[文章编号]100123601(2006)增刊2018220093203

SSR分子标记的发展及其在动植物遗传育种中的应用

朱英1,2,陶刚1,3,刘作易1,43
(1.贵州省农业生物技术重点实验室,贵阳550006;2.贵州省农业科学院生物技术研究所,贵阳550006;
3.贵州省农业科学院植物保护研究所,贵阳550006;4.贵州省农业科学院,贵阳550006)

[摘要]SSR是建立在PCR技术上的一种广泛应用的分子标记,本文对SSR标记的发展、特点及其在遗传图谱的构建、
品种鉴定和在动植物育种等方面的研究进展进行了概述。
[关键词]SSR;分子标记;育种
[中图分类号]Q75;Q78[文献标识码]A
DevelopmentofSSRMarkerandItsApplicationinPlant
andAnimalGeneticsandBreeding
ZHUYing1,2,TAOGang1,3,LIUZuo2yi1,43
(1.TheKeyLaboratoryforAgricultureBiotechnologyofGuizhou,Guiyang550006;2.InstituteofBiotechnology,
GuizhouAcademyofAgriculturalSciences,Guiyang550006;3.InstituteofPlantProtection,GuizhouAcademyof
AgriculturalSciences,Guiyang550006;4.GuizhouAcademyofAgriculturalSciences,Guiyang550006,China)

Abstract:SSR(SimpleSequenceRepeats)isaclassictechniqueformolecularmarker.Thedevelopmentand
characteristicoftheSSRMarkerwasreviewed,andthecurrentresearchadvanceofgeneticmapping,identificationofvariety
andmolecularmarkerinplantandanimalbreedingwerealsodiscussedinthispaper.
Keywords:SimpleSequenceRepeats(SSR);molecularmarker;breeding

在人类及动植物的基因组中,包括内含子、编码本单元重复次数在不同基因型间差异很大,从而形
区及染色体上的任一区域,均存在着由1～6个核苷成其座位的多态性。而且每个SSR座位两侧一般
酸为基本重复单位的串联重复序列(simplese2是相对保守的单拷贝序列,据此可设计引物,进行
quencerepeats),简称SSR,又称微卫星DNA(mic2PCR扩增,其关键是首先要了解SSR座位两侧的核
rosatelliteDNA),其长度大多在100bp以内[1]。研苷酸序列,寻找其中的特异保守区,这就是SSR分
究表明,在真核生物中大约每隔10～50kb就存在1子标记的基本原理。对于一个新物种,使用该技术
个微卫星[2],其主要以2个核苷酸为重复单位,也有的研究,具体技术路线是:首先建立该物种的DNA
一些微卫星重复单位为3个核苷酸,极少数为4个文库,筛选鉴定微卫星DNA克隆,然后测定这些克
核苷酸或更多,如(GA)n、(AC)n、(GAA)n、(GA2隆的侧翼序列,也可通过Genbank、EMBL和DDBJ
TA)n等。人和动物中的微卫星重复单位主要为等DNA序列数据库搜索SSR序列,再根据SSR两
(TG),植物基因组中(AT)重复较(AC)重复更为普侧序列在同一物种内高度保守的特性,设计一对特
遍[3]。而且从进化的角度看,物种间重复序列的差异性引物来扩增SSR序列,再经聚丙烯酰胺凝胶电
异是自然选择和生物对环境适应的结果,生物进化泳、染色,通过比较谱带的相对迁移距离,便可得到
的水平越高,重复序列占DNA总量的比重就越大,不同个体在某个SSR座位上的多态性信息(图1、图
如噬菌体基因组中重复序列占10%,细菌为20%,2)[8]。
酵母为30%,小麦为83%,在人的基因组中这一指
数高达90%[4]。SSR较早应用于人类和哺乳动物
的研究,既可作探针进行Southern分析,又可根据
其两侧独特的序列设计引物,进行PCR扩增检测。
近年来,SSR已经成为构建遗传连锁图谱非常有效
的分子标记[5～7]。下面从SSR分子标记的技术原
理、发展以及在动植物遗传育种等