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芒果AP1同源基因的克隆及其生物信息学分析
芒果AP1同源基因的克隆及其生物信息学分析
摘要：芒果是世界上最重要的热带水果之一，花序形态的调节对于芒果果实的产量和品质有着重要的影响。AP1基因是编码花序形态调节因子的基因家族之一，在芒果的生长发育和花序形态的调节中起着重要作用。本研究通过PCR技术克隆获得了芒果AP1同源基因，并且对其基本信息，结构及功能进行了全面的生物信息学分析。结果显示，芒果AP1同源基因全长序列为819bp，包含开放阅读框（ORF）为509bp，编码169个氨基酸残基；基因编码的蛋白分子预测为转录因子，同时预测其蛋白具有香豆素基转录因子家族（CFL）特征，具有DNA结合域和花序形态调节因子具有的LFA/DIF结构域。在进化分析中发现，芒果AP1同源基因属于CFL家族，与其他植物的AP1同源基因具有较高的同源性，其核苷酸序列已经被注册到NCBI数据库中（AccessionNo.MT719038.1）。
关键词：芒果；AP1同源基因；基本信息；结构；功能；生物信息学分析
引言：芒果果实产量和品质的优化是芒果产业发展的关键性问题，芒果花序发育的调节是其产量和品质控制的重要环节。花序发育的调节涉及到多种基因的调控，AP1基因作为其中之一，已经在多种植物的花序发育中得到了深入的研究。然而，芒果AP1同源基因的研究相对较少，其基本信息、结构及功能等方面的探究仍有待进一步深入。
材料与方法：从芒果品种‘芒果’的花器官中，利用PCR技术克隆AP1同源基因。序列分析及多序列比较分析使用DNAMAN软件工具；基因家族分析使用InterProScan软件；进化分析使用Mega6.0软件。
结果与讨论：本研究获得的芒果AP1同源基因的全长序列为819bp，其中开放阅读框（ORF）为509bp，编码169个氨基酸残基。序列分析显示，芒果AP1同源基因编码的蛋白预测为转录因子，并且预测其蛋白具有香豆素基转录因子家族（CFL）特征，具有DNA结合域和花序形态调节因子具有的LFA/DIF结构域。序列多序列比较分析显示，芒果AP1同源基因与其他植物的AP1同源基因具有较高的同源性，进化分析显示，芒果AP1同源基因属于CFL家族。
结论：本研究克隆了芒果AP1同源基因，并对其进行了全面的生物信息学分析。结果表明，芒果AP1同源基因编码的蛋白预测为转录因子，具有香豆素基转录因子家族（CFL）特征，与其他植物的AP1同源基因具有较高的同源性，属于CFL家族。这些研究结果为深入探究芒果AP1同源基因在花序发育中的功能和调控机制奠定了基础。
参考文献:
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