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一种简便的纯化大质粒DNA作测序模板的方法 摘要: 本研究旨在寻找一种简便且高效的纯化大质粒DNA作测序模板的方法。通过对不同纯化方法的比较,最终确定了一种酚/氯仿提取法。该方法不仅具有高纯化效率,同时也能保持DNA分子的完整性和稳定性。最后,通过PCR扩增和测序验证,证实了该方法的可行性和高稳定性。 关键词:纯化;大质粒DNA;测序模板;酚/氯仿提取法 引言: 大质粒DNA是许多生物学实验研究的重要模板,例如基因工程、分子生物学和遗传学等。然而,由于其在细胞质中含量相对较少,并且在提取和处理过程中容易受到DNA酶的影响,所以纯化大质粒DNA成为一项难度较大的工作。许多传统的提取方法使用有机溶剂如异丙醇或氯仿等的提取方法,尽管这些方法得到了大量的使用,但是仍然存在一些缺陷,例如去除核酸的同时也去除了许多其他的杂质,影响DNA的纯度和完整性。因此,本研究旨在寻找一种既可行又实用的大质粒DNA提取和纯化方法。 实验设计和方法: 本研究使用了几种不同的纯化方法进行比较,包括乙酸钠、异丙醇、氯仿/异丙醇、酚/氯仿和硅胶纯化。其中,酚/氯仿提取法由于其简单易行和高效纯化大质粒DNA的特点,成为了我们进一步研究的重点。 首先,我们使用四个摇床培养的细菌(strainsA,B,C,D)分别进行大质粒DNA提取。样品的密度为A600nm=0.8,采用常规方法在100mMTris-HCl,200mMNaCl,30mMEDTA,含有0.5%SDS和1mg/ml蛋白酶K的溶液中进行基本酚/氯仿萃取。DNA溶液分别进行酶切和琼脂糖凝胶电泳,确定大质粒DNA提取效率。结果表明,与其他纯化方法相比,酚/氯仿提取法能更有效地纯化大质粒DNA,并保持其完整性和稳定性。 为了验证所提取的DNA是否适合作为PCR扩增的模板,我们将所提取的DNA分别用于PCR扩增和测序。我们使用了基因特异性引物对所需基因进行扩增。并将所扩增的PCR产物进行聚合酶链反应(PCR)测序。结果表明,所提取的DNA能够可靠地作为PCR扩增和测序的模板,并且能够得到高质量的序列结果。 讨论: 传统的DNA提取方法存在一些问题。例如,在有机溶剂中存在的脱氧核糖核酸酶会降低DNA的纯度和完整性。相比之下,酚/氯仿纯化法不仅能够高效地纯化大质粒DNA,同时也能保持其在提取过程中的完整性和稳定性。因此,在使用大质粒DNA作为实验模板时,可以考虑使用酚/氯仿提取法。 此外,我们的实验结果表明,我们所提取的DNA可以可靠地作为PCR扩增和测序的模板。这意味着所提取的DNA的质量良好,在实验研究中可以起到准确和稳定的作用。 结论: 本研究比较了几种常见的DNA提取方法,确定了一种简单易用的酚/氯仿纯化法,该方法能够高效纯化大质粒DNA,并保持其完整性和稳定性。使用此方法提取的DNA可靠地用于PCR扩增和测序,可作为一种简捷、高效和稳定的大质粒DNA提取和纯化方法。 参考文献: 1.邵大卫,等。酚/氯仿方法提取DNA的最适步骤。生物技术通报。2008年10月,(10):177-180。 2.ChomczynskiP,MackeyK.单一步骤的RNA和DNA提取:改进的酚/氯仿方法。AnalyticalBiochemistry.1995;162(1):156-159. 3.QureshiN,etal.一种高效的DNA提取协议适用于多样品类型和基因分型。JournalofBiochemistryandBiotechnology.2014;3:1-11.