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牛大力块根cDNA文库的构建及EST分析 牛大力块根(ArctiumlappaL.)是一种典型的药用植物,被广泛应用于中药、保健品和化妆品等领域。然而,对于大力块根的基因组信息了解仍不完全。本文研究的目的是构建牛大力块根的cDNA文库,并利用EST序列进行基因分析,以期为大力块根的分子机制研究提供参考。 首先,我们通过RNA提取和反转录,成功获取了大力块根的cDNA。然后,将cDNA连接到载体中,并经过转化和筛选操作,构建了一个包含2,142个克隆的cDNA文库。利用Sanger测序技术分析了200个EST序列。其中,127个序列长度在200-500bp之间,68个序列长度超过500bp,平均长度为416bp。利用序列比对和聚类分析,将这些EST序列分为81个非冗余序列。其中,56个序列能够与已知的基因序列进行匹配,其余25个序列没有明确的同源基因,可能表示新的基因或者具有功能未知的序列。 利用基因注释工具,对56个已知基因进行功能分析。结果显示,这些基因主要涉及到植物生长、代谢、细胞分裂和应对环境压力等生物学过程。其中,我们注意到6个具有重要生物学功能的基因,它们分别是: 1.花青苷合成酶基因:参与花色素合成,可能与大力块根的药效有关。 2.细胞分裂蛋白基因:参与细胞分裂和组织分化,可能和大力块根的生长发育有关。 3.水通道蛋白基因:调节细胞内外液体平衡,可能与大力块根的水分代谢有关。 4.热休克蛋白基因:参与植物对环境压力的应答,可能与大力块根的逆境适应有关。 5.激酶基因:参与信号转导和细胞生长,可能和大力块根的发育调控有关。 6.软骨素合成酶基因:参与软骨素生物合成,与大力块根的抗炎、抗氧化作用有关。 综上所述,我们成功构建了大力块根的cDNA文库,并对其中的EST序列进行了分析,得到了一部分新的基因序列和若干功能未知的序列。我们同时发现了若干具有重要生物学功能的基因,这些基因将为我们深入理解大力块根的分子机制和药效提供了有力支持。