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临床检测样本RNA提取方法的比较研究 动物医学院专业学生苏华健 指导教师周斌 摘要:选择市售的三种细胞裂解液(RNAisoPlus、TRNzolPlus和RNAOUT)和两种DNA\RNA 共提试剂盒(柱式病毒RNA-DNA双提试剂盒、QeasyTM快速DNA/RNA共提试剂盒),分 别对猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪瘟病毒(CSFV)和乙型脑炎病毒(JEV)三种 病毒RNA进行提取,通过琼脂糖凝胶电泳和Real-timePCR间接评价所提取的RNA质量。 结果表明:对于琼脂糖凝胶电泳,上述三种细胞裂解液和QeasyTM快速DNA/RNA共提试 剂盒对应的组均可见清晰且高亮的条带,可用于临床RNA病毒检测以及定性分析。对于 Real-timePCR,QeasyTM快速DNA/RNA共提试剂盒CT值最低,RNAisoPlus、TRNzolPlus 两种细胞裂解液其次,以上三种试剂可用于临床RNA病毒检测以及定量分析。 关键词:RNA;提取方法;比较;临床 ComparisonofMethodsofclinicaltestsamplesRNAextraction StudentmajoringinveterinarymedicineSuHuajian TutorZhouBin Abstract:Threecommerciallyavailablecelllysates(RNAisoPlus,TRNzolPlusandRNAOUT) andtwoDNA/RNAco-kits(LC-DNAdouble-kit,QeasyTMrapidDNA/RNAco-kit)were selectedtoextractthreeanimalRNAviruses(PRRSV,CSFVandJEV).TheRNAqualitywas evaluatedindirectlybyagarosegelelectrophoresisandReal-timePCR.Theresultshows,for agarosegelelectrophoresis,theclearlyandhighlightbandscanbeseenabovethegroupsofthe threecelllysatesandQeasyTMrapidDNA/RNAco-kit,whichcanbeusedforclinicalRNAvirus detectionandqualitativeanalysis.ForReal-timePCR,theCTvalueoftheQeasyTMrapidDNA/ RNAco-kitgroupisthelowest,andthetwocelllysatesgroups(RNAisoPlus,TRNzolPlus) followed.TheabovethreereagentscanbeusedforclinicalRNAvirusdetectionandquantitative analysis. Keywords:RNA;ExtractionMethod;Comparison;Clinical RNA是生物体重要的遗传物质[1]。近年来,越来越多的科研结果表明,RNA 在生命进程中的作用远不止于此,在2002年度Science评选的10大科学成就中 RNA名列榜首。 RNA分子提取是生物学研究中的一项基本内容,是进行基因表达分析的基 础[2]。对于cDNA文库构建、荧光定量PCR、RT-PCR、Northern杂交等下游分子 生物学实验来说,都需要质量好的,完整性高的RNA[3]。 在所有RNA试验中最关键的因素是分离得到全长RNA。分离出纯度高且完 整的RNA是进行基因表达分析及RNA结构功能研究的基础。在所有RNA实验 中,最关键的步骤是分离得到纯度高且完整的RNA。,从组织细胞中分离纯粹完 整的RNA对于分子克隆和基因表达分析等试验是至关重要的[4,5] Chomczyski和Sacchi第一次提出了用异硫氰酸胍法提取细胞内的RNA[6], 使得RNA的提取过程变得简便快捷。常见的RNA提取方法有强变性剂法[7]、 CTAB法[8]、SDS-Phenol法[9]以及热硼酸法[10]等。在商品化的今天,国内外生物 试剂公司研发出了许多RNA提取试剂盒。比如Takara公司的RNAisoPlus; Invitrogen公司的Trizol总RNA提取试剂盒以及PureLink™RNAMiniKit;上 海生工的UNlQ-10柱式Trizol总RNA抽提试剂盒;Omega公司的RNA小量 提取试剂盒(BacteriaRNAkit)以及高纯RNA抽提试剂盒(HPtotalRNAkit); Qiagen公司的RNeasyProte