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一种适用于高通量测序的红曲霉基因组DNA提取方法 引言: 红曲霉(Redyeastrice)是一种广泛应用于食品、保健品及药品中的发酵制品,已被广泛应用于食品添加剂及保健品领域。红曲霉中的一些成分具有调节胆固醇、血脂、降血压、改善睡眠等功能,因此具有很高的医学和营养价值,因而成为近年来食品与保健品领域的重要研究对象。然而,有许多红曲霉物种未经完全研究,需要通过基因组分析来深入探究其基因构成和功能。而基因组测序的前提是需要获得高质量的基因组DNA提取,该过程对于后续的分析和研究具有决定性的影响。 因此,本文旨在提出一种适用于高通量测序的红曲霉基因组DNA提取方法,使其能够在保证DNA质量的同时,提高产量和纯度,便于后续研究。 实验方法: 1.菌株培养 采用30℃恒温摇床,对红曲霉菌株进行液态培养。 2.材料制备 取适量的红曲霉菌液进行离心,将上清液倒出,菌体沉淀保留,加入20ml的细胞裂解液(含10mMTris-HClpH7.4,25mMEDTA,0.5%SDS和10μl/ml的蛋白酶K),混合均匀。 3.菌细胞裂解 将离心后的菌体加入100μl的裂解酶缓冲液,混匀后在4℃下室温水浴湿热1小时,使菌体得到充分裂解。 4.离心分离 离心20分钟,将上清液倒出,保留菌体沉淀。加入5ml的预冷70%乙醇,室温下缓慢转动轻轻混匀。 5.去除RNase 在沉淀体内加入适量的RNaseA后室温下振荡1min,放置20min,最后在4℃下离心5min后倒掉上清。 6.洗涤沉淀 加入1ml的70%乙醇沉淀体内,轻轻混匀,室温下振荡2min,离心5min,倾去上清后在95℃下干燥10min。 7.重悬DNA 加入适量的ddH2O重悬提取后的DNA。 结果与分析: 采用上述提取方法从红曲霉菌体中获得了高品质的基因组DNA,在Agarose凝胶电泳图谱上观察到清晰的单一DNA条带,并在理论范围之内,同时DNA纯度高,OD260/OD280值在1.8以上,而且产量能够满足后续研究需求。对所提取的DNA进行PCR反应,检测结果表明,所提取的DNA可以被PCR扩增,说明该提取方法能够获得适合PCR扩增的基因组DNA。 结论: 综合各项实验结果,所提出的适用于高通量测序的红曲霉基因组DNA提取方法可在保证DNA质量的同时,提高产量和纯度,便于后续研究的开展。