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靶向抗细菌生物膜活性的YycG组氨酸激酶小分子抑制剂的设计与合成 细菌生物膜是细菌在环境压力下形成的防御性结构,它由聚合物和细菌细胞组成,可降低细菌对抗生素和免疫系统的敏感性,因此对于细菌的清除极为困难。YycG组氨酸激酶是其中一个在生物膜形成中起关键作用的酶,因此它成为设计和合成新型抑制剂的目标。 本文从已知的多个YycG结构入手,经过分析和计算机模拟的方法,发现YycG具有两个结构域,分别为N-末端和C-末端结构域,且均含若干磷酸酯结合位点。因此,设计的小分子化合物应该能够和这些结构域形成稳定的相互作用,并能够抑制YycG的酶活性。 因此,在设计方面,我们首先通过分子对接和选择性筛选的方法,评估了大量小分子化合物在YycG的活性位点上的结合能力和选择性。比较研究了小分子与YycG的结合模式,确定了最有前途的抑制剂分子,其中之一就是基于YycG结构域设计的小分子抑制剂,其理论计算的活性分子性质已经很好地表现出抑制YycG酶活性的潜质。 在合成方面,我们采用了多步的有机合成方法来合成该分子抑制剂。首先,我们合成了分子骨架,并添加适当的官能团,最终将小分子抑制剂合成。然后通过核磁共振和质谱谱学技术,确证了合成的化合物的结构,并利用相关荧光探针等工具检测其在细菌生物膜中的稳定性。 最后,为了评估得到的小分子抑制剂的抑制效果,我们进行了体外实验和部分细菌动物模型实验。在实验中,该小分子抑制剂能够显著地抑制YycG酶活性,并阻止细菌的生物膜形成。实验结果表明,该小分子抑制剂具有潜在的抗菌活性,并为设计和合成更加有效和选择性的YycG小分子抑制剂提供了重要参考。 综合以上,本研究为探索和开发新型的可用于治疗细菌感染的药物提供了有益的思路,同时也为更好地理解细菌生物膜形成机制提供了新的涉及领域。