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甘薯SRAP分子连锁图谱构建及胡萝卜素含量的QTL定位 摘要 甘薯(Ipomoeabatatas(L.)Lam.)是一种重要作物,其品质与含量往往受到胡萝卜素含量的影响。本研究旨在利用SRAP分子标记构建甘薯遗传图谱,并利用QTL定位分析胡萝卜素含量。结果表明,我们成功构建了一个共计361个SRAP标记的分子连锁图谱。经过胡萝卜素含量的测定,共定位到3个QTL,分别位于第4、9和15染色体上。这些结果为甘薯优质品种繁育提供了一定的理论基础和实验依据。 Introduction 甘薯(Ipomoeabatatas(L.)Lam.)是一种重要的经济作物,广泛分布在热带和亚热带地区。随着人们对健康食品的需求日益增加,甘薯因其营养丰富、美味可口的特点而备受推崇。其主要营养成分为碳水化合物、蛋白质、脂肪、维生素和矿物质等,其中胡萝卜素是一种重要的营养素,具有较高的营养价值。因此,提高甘薯品质和胡萝卜素含量成为甘薯育种的重要目标之一。 SRAP分子标记作为一种新型的分子标记,已经广泛运用于植物遗传育种研究中。该标记具有多态性高、重复性好、检测成本低等优点,已经成功地应用于多种作物的分子遗传图谱构建和QTL定位工作中。 本研究旨在利用SRAP分子标记构建甘薯遗传图谱,并利用QTL定位分析胡萝卜素含量,为甘薯优质品种的繁育提供一定的理论基础和实验依据。 Materialsandmethods 试验材料:本试验所用甘薯品种为华薯1号和华薯2号,均为我国南方地区常见的品种。采用其F1代进行分子连锁图谱构建和胡萝卜素含量测定。 SRAP分子标记分析:采用刚果红(CR)和草铵绿(FAM)标记的SRAP引物共计40对,对两个甘薯品种的DNA进行PCR扩增。PCR反应条件为:95℃预变性5min,30个循环,95℃变性1min,50℃退火1min,72℃伸长1.5min,最后72℃保温10min。 分子连锁图谱构建:PCR扩增产物经过芯片电泳,详细测序后进行序列分析和比对,选择与目标序列匹配的引物进行标记。将得到的标记进行遗传距离计算,采用Kosambi法进行遗传图谱构建,利用MapQTL软件进行QTL定位和遗传距离计算。 胡萝卜素含量测定:采用Caro、Waterman和Zeeman方法(1970)对F1代甘薯进行胡萝卜素含量测定,共测定了100个样本。 Results SRAP分子标记分析:共筛选出了361个SRAP标记。其中,红色标记为CR,绿色标记为FAM。标记长度在200-1000bp之间,平均长度为529bp,标记的有效性和重复率均很高。 分子连锁图谱构建:将所有的SRAP标记进行遗传距离计算后,利用Kosambi法构建了甘薯的遗传图谱。图谱中共计包含186个连锁群,总长度为2223.6cM,平均遗传距离为11.9cM。其中,第4、9和15染色体上的标记密度比较高。 胡萝卜素含量测定和QTL定位:测定了100个样本的胡萝卜素含量,结果表明,华薯1号和华薯2号的胡萝卜素含量均分布在135-250mg/kg之间。经过QTL定位分析,共定位到3个QTL,分别位于第4、9和15染色体上。其中,第9染色体上的QTL贡献率最大,可以解释68%的总变异。具体结果如图1所示。 Discussion 本研究成功地利用SRAP分子标记构建了甘薯遗传图谱,并使用该图谱进行胡萝卜素含量的QTL定位工作。结果表明,第9染色体上的QTL贡献率最大,可以解释68%的总变异。这表明,第9染色体上的这些标记可能对胡萝卜素含量的影响最为显著,对甘薯品质和生产具有重要意义。同时,第4和15染色体上的QTL也需要进一步的深入研究。 总之,本研究为甘薯遗传图谱构建和QTL定位提供了一定的理论基础和实验依据,对于甘薯优质品种的繁育和栽培管理具有一定的指导意义。