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DNMT1基因shRNA慢病毒稳定转染KYSE150细胞株的建立及鉴定 DNMT1基因shRNA慢病毒稳定转染KYSE150细胞株的建立及鉴定 摘要:DNA甲基转移酶1(DNMT1)是DNA甲基化的关键酶,其在细胞增殖、分化、凋亡等过程中发挥重要作用。本实验旨在通过稳定转染shRNA来沉默KYSE150细胞株中的DNMT1基因,并建立shRNA转染成功的实验组和对照组。结果表明,稳定转染后DNMT1基因的表达水平明显下降,且转染组细胞的增殖能力和侵袭能力均明显降低,说明本实验成功建立了稳定转染DNMT1shRNA的KYSE150细胞株。 关键词:DNMT1基因;shRNA慢病毒;转染;细胞株 一、引言 DNMT1是DNA甲基转移酶家族成员之一,在维护基因组DNA甲基化修饰状态中发挥着极其重要的作用。已有研究表明,DNMT1在肿瘤细胞中的表达水平往往明显升高,导致肿瘤的生长和转移。因此,通过靶向沉默DNMT1基因,有望从分子水平上探究其在肿瘤发生和发展过程中的作用机制。 RNA干扰技术已经成为靶向沉默特定基因的一种重要手段。其中,利用慢病毒稳定转染shRNA技术能够有效沉默目的基因,从而实现探究基因功能和相关疾病的机制。因此,本实验利用shRNA慢病毒技术,旨在成功建立稳定转染DNMT1shRNA的KYSE150细胞株,并对其进行鉴定与评价。 二、材料与方法 2.1实验材料 KYSE150细胞株、shRNA载体pLKO.1、慢病毒包装质粒、293T细胞、Opti-MEM培养基、DMEM培养基、FBS、脱氧胆酸、Matrigel。 2.2实验方法 2.2.1DNMT1shRNA的设计与构建 利用RNAi设计算法设计出4个针对DNMT1的shRNA,筛选出最佳的shRNA序列,插入到pLKO.1载体中,构建出含有DMNT1shRNA的慢病毒载体。 2.2.2慢病毒包装及稳定转染 将含有DNMT1shRNA和包装元件的慢病毒质粒转染到293T细胞中,等待包装完成。采用脱氧胆酸盐/PEG共沉淀法收集慢病毒上清液,加入Matrigel后稳定转染KYSE150细胞株。 2.2.3稳定转染细胞的筛选及鉴定 通过荧光定量PCR和Westernblotting等方法筛选出含有DNMT1shRNA的KYSE150细胞株。使用CCK-8、Transwell和WoundHealing等细胞功能实验,对转染组和对照组细胞的生长、增殖、迁移和侵袭等性质进行分析。 三、结果 3.1DNMT1shRNA的构建 本研究设计了4个针对DNMT1的shRNA序列,通过荧光定量PCR检测,发现shRNA构建成功,并成功插入pLKO.1载体中(图1)。 3.2KYSE150细胞株的慢病毒转染 将包含DNMT1shRNA和包装元件的慢病毒质粒转染到293T细胞中,并采用脱氧胆酸盐/PEG共沉淀法收集慢病毒上清液,加入Matrigel后转染KYSE150细胞株。稳定转染后,转染组和对照组细胞均呈现正常生长和形态(图2)。 3.3转染细胞的筛选及鉴定 通过荧光定量PCR和Westernblotting等方法筛选出含有DNMT1shRNA的KYSE150细胞株,发现转染组DNMT1基因的表达水平已经明显下降(图3)。同时,转染组细胞的增殖能力和侵袭能力均明显降低,说明DNMT1shRNA的转染成功沉默了DNMT1基因(图4)。 四、讨论 DNMT1是DNA甲基转移酶家族成员之一,在肿瘤细胞中起着重要的作用。由于其对DNA甲基化修饰状态的维护和调控,在肿瘤生长和转移过程中始终存在着较高的表达水平。因此,针对DNMT1基因进行RNA干扰,是一种有望治疗肿瘤的手段。在此实验中,我们设计了4个针对DNMT1的shRNA序列,并通过荧光定量PCR检测,发现其中一组shRNA序列的构建成功。 慢病毒稳定转染技术已经成为靶向沉默目的基因的一种常用方法。在本研究中,我们将包含DNMT1shRNA和包装元件的慢病毒质粒,转染到293T细胞中包装成病毒,再加入Matrigel转染到KYSE150细胞株中。通过荧光定量PCR和Westernblotting等方法筛选出含有DNMT1shRNA的KYSE150细胞株,发现DNMT1基因的表达水平明显下降。 此外,在转染组细胞的功能实验中,我们发现转染组细胞的生长、增殖、侵袭等能力均明显降低,说明DNMT1shRNA的稳定转染成功沉默了DNMT1基因,在一定程度上抑制了细胞的生长和转移。 综上所述,本实验成功建立了含有DNMT1shRNA的慢病毒稳定转染KYSE150细胞株,实现对DNMT1基因的沉默,并初步评估了其对肿瘤细胞生长和转移的影响。该研究结果为进一步探究DNMT1基因在肿瘤生长和转移中的作用机制提供了实验基础。 参考文献 1.Li,X.,&K