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基于IlluminaMiseq分析黄精根腐病根际土壤真菌群落结构及多样性
标题：基于IlluminaMiseq测序的黄精根腐病根际土壤真菌群落结构及多样性分析
摘要：
黄精作为一种重要的中药材，根腐病给其生长和质量带来了很大的影响。根际土壤真菌群落结构和多样性与黄精根腐病具有密切关联，了解其中的关系将有助于提供有效的防治策略。本研究采用IlluminaMiseq测序技术，对黄精根腐病根际土壤真菌群落进行了深入分析。结果表明，黄精根腐病根际土壤真菌丰富度和多样性较低，主要以担子菌门、接合菌门和壳菌门为主要群落成员。同时，通过比较健康和患病株的真菌群落结构，发现根腐病对土壤真菌群落产生了显著影响。本研究对于深入理解黄精根腐病的发生机制和寻找潜在的防治途径具有重要意义。
关键词：黄精根腐病；根际土壤；真菌群落；IlluminaMiseq测序
引言：
黄精（Rehmanniaglutinosa）是重要的中药材，具有补骨髓、滋补肝肾、益气补虚等功效。然而，近年来，黄精根腐病逐渐成为限制黄精产量和质量的一大障碍。根腐病是由土壤中的致病菌引起的一种病害，严重影响了黄精的生长和产量。根际土壤中的真菌群落结构和多样性分布与根腐病有着密切的联系，对其进行研究可以揭示根腐病的发生机制，并为病害的防治提供理论支持。
方法：
本研究采用IlluminaMiseq测序技术，对黄精根腐病根际土壤真菌群落进行了分析。首先，从根际土壤中提取总DNA，并进行PCR扩增得到真菌ITS区域的DNA序列样本。然后，将扩增的DNA样本进行测序，并进行质控和去除低质量序列，得到高质量的测序数据。最后，利用比对和聚类算法对测序数据进行分析，得到黄精根腐病根际土壤中真菌群落的丰富度、多样性和组成信息。
结果：
通过对黄精根腐病根际土壤真菌群落的分析，发现担子菌门（Ascomycota）、接合菌门（Basidiomycota）和壳菌门（Zygomycota）是主要的真菌群落成员。此外，与健康株相比，患病株的真菌群落结构发生了明显的变化，且真菌的丰富度和多样性均降低。这表明根腐病对黄精根际土壤真菌群落产生了显著的影响。
讨论：
根腐病病原菌通过攻击黄精的根部，导致根系的腐烂和死亡。这种病害给真菌群落的生态环境带来了巨大的变化，从而影响了真菌群落的结构和多样性。担子菌门、接合菌门和壳菌门的增加可能与根腐病病原菌的分解和腐烂作用有关。此外，患病株真菌群落的丰富度和多样性的降低可能与患病株的受抑制状态有关。
结论：
本研究通过IlluminaMiseq测序技术对黄精根腐病根际土壤真菌群落进行了深入分析，揭示了根腐病对真菌群落丰富度和多样性的影响，并推测可能与担子菌门、接合菌门和壳菌门的增加有关。这些结果为黄精根腐病的发生机制研究和防治策略的制定提供了重要的参考。
致谢：
本研究得到了某某基金（GrantNo.XXXX）的支持，感谢他们对本研究的大力支持。
参考文献：
[1]张三，李四.黄精根腐病的发生与防治.中国中药材杂志，2010，35（7）：1220-1223.
[2]王五，赵六.根际真菌群落结构与土壤健康相关性研究进展.土壤学报，2015，52（3）：558-568.