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蛋白质组(proteome):由一个细胞或一个组织的基因组所表达的全部相应的蛋白质。 蛋白质组学(proteomics):是研究蛋白质组或应用大规模蛋白质分离和识别技术研究蛋白质组的一门学科。人类基因组计划的完成3-4万个基因,30亿对碱基 基因组是唯一的,但蛋白表达是变化的 后基因组—蛋白质组的研究是21世纪生命科学的主要任务(WilkinsMRetal1997) 1994年Williams提出测定有机体的基因组所表达的全部蛋白 1995年Wilkins正式提出Proteome一词由一个细胞或一个组织的基因组所表达的全部相应的蛋白质,而研究蛋白质组功能为蛋白质组学(Proteomics)(一)基因组与蛋白质组比较基因组转录组蛋白组 Expressionproteomics (表达蛋白组学) Thestudyofglobalchangesinproteinexpression(二)蛋白质组研究的主要方法蛋白组研究的三个主要步骤: Separationofindividualproteinsby2-Dpolyacrylamidegelelectrophoresis(2-DPAGE) IdentificationbymassspectrometryorN-terminalsequencingofindividualproteinsrecoveredfromthegel Storage,manipulation,andcomparisonofthedatausingbioinformatics Sample Prep双向电泳技术质谱分析(MS):生物信息学 生物信息学在基因组学/蛋白质组学的研究中起重要作用。包括数据的输入、储存、加工、索取以及数据库之间的联系。 数据处理需要设计各种特殊软件,对数据进行综合分析,不同的数据库之间要有高效自动的应答。 数据库要有严密管理。蛋白质组比基因组具有更大的复杂性。 基因组学/蛋白质组学的发展促使生物信息学迅速发展。 例如用生物信息学对质谱得到的肽指纹图谱(peptide-massfingerprinting)分析出了一个新的在进化过程中保守的模序(motif),它对蛋白质的结构和功能具有重要意义。用分子建模(molecularmodelling)