遗传标记在植物遗传育种中的应用.pptx

遗传标识在植物遗传育种中应用遗传标识（geneticmarker）:指可追踪染色体、染色体某一片段、某个基因座在家系中传递任何一个遗传特征。它含有两个基本特征，即可遗传性和可识别性；所以生物任何有差异表型基因突变型均可作为遗传标识。遗传标识类型即植物外部形态特征。主要包含肉眼可见外部特征，如：矮秆、紫鞘、卷叶等；也包含色素、生理特征、生殖特征、抗病虫性等相关一些特征。
优点：形态标识简单直观、经济方便。
缺点:(1)数量在多数植物中是很有限。
(2)表现易受环境影响。
(3)有一些标识与不良性状连锁。
(4)形态标识取得需要经过诱变、分离纯合过程，周期较长。
形态标识在作物遗传育种中作用是有限。（亚洲棉×陆地棉）杂种F1与其亲本形态特征比较二、细胞学标识（1）核型和核型分析核型分析：核型分析就是指对核型各种特征进行定量和定性表述。核型分析是分析染色体数目和结构变异基本伎俩之一。它在杂种细胞染色体研究和基因定位，单个染色体识别等方面含有主要意义。蚕豆核型分析核型分析内容:1.染色体数目2.染色体形态
核型分析应用:
1.植物分类研究
2.探讨物种起源
3.外源染色体检测与验证杂种真实性（2）带型人类染色体核型分析（Q带）女与形态标识相比，细胞学标识优点是能进行一些主要基因染色体或染色体区域定位。但细胞学标识材料需要花费较大人力和较长时间来培育，难度很大；同时一些物种对染色体变异反应敏感；还有些变异难以用细胞学方法进行检测。所以到当前为止，真正应用于作物遗传育种研究中细胞学标识还极少。利用电泳技术对蛋白质、酶等生物大分子进行判定。主要包含同工酶和等位酶标识。
同工酶：含有功效相同而结构和理化性质不一样一类酶。
等位酶：同一基因座上不一样等位基因编码同工酶。
种子贮藏蛋白电泳分析已广泛用于作物品种判别和种子纯度判定。
生化标记优点：
1.表现近中性，对植物经济性状普通没有大不良影响。
2.直接反应了基因产物差异，受环境影响较小。
但当前可使用生化标识数量还相当有限，且有些酶染色方法和电泳技术有一定难度，所以其实际应用受到一定限制。生化标识应用四、分子标识
以DNA多态性为基础遗传标识。分子标识特点分子标识类型及原理原位杂交PCRPCRPCRPCRPCRPCRPCRDNABetweenThePrimersDoublesWithEachThermalCycle经过PCR扩增染色体组DNA所取得长度不一样多态性DNA片段。随机排列寡聚脱氧核苷酸单链引物（10个核苷酸）。
HistoryComponentsofaPCRandRAPDReactionsModifyingThermalCyclingRAPDRAPDRAPDRAPDTemplateDNAM单个引物可产生几个多态位点RAPD优点：
1.无需杂交，设计引物也无须知道序列息。
2.DNA需要量少，引物廉价，成本较低。
3.技术简便，操作方便、快速，不包括分子杂交和放射性自显影等技术。
4.不一样物种间引物通用。
缺点：1.大多显性遗传，不能判别杂合和纯合子；2.试验重复性较差，结果可靠性较低。2.简单重复序列（SimpleSequenceRepeat，
SSR；alsoknownasmicrosatellitesorsimple
sequencelengthpolymorphisms，SSLP）
一类由1—6个碱基组成基序（motif）串联重复而成DNA序列，依据关键序列碱基数不一样,可分为单碱基、2碱基、3碱基、4碱基等各种重复型。
真核生物基因组普遍存在，呈随机分布,大约每隔10-50kb就存在一个SSR。
不一样物种其重复序列及重复单位频率不一样。
经过对54个植物种核DNA和28个植物种细胞器DNASSR(1-4bp)搜索，发觉：
(AT)ｎ最丰富，然后依次是:(A)n、(T)n、(AG)n、(CT)n、(AAT)n、(ATT)n、(AAC)n、(GTT)n、(AGC)n、(GCT)n、(AAG)n、(CTT)n、(AATT)n、(TTAA)n、(AAAT)n、(ATTT)n及(AC)n、(GT)n。
同一类内碱基种类不一样SSR，丰度差异很大。DNA复制或修复过程中分子滑动（slippagereplication）或不等交换所致。微卫星DNA两端序列是相对保守单拷贝序列⑥凝胶电泳检测2）检测一个单一多等位基因位点不足：
相正确物种专一性；
因为开发时需针对每个座位微卫星序列，发觉其两端单拷贝序列设计引物，需建立基因文库、克隆识别与筛选、测序等过程，开发困难，费用较高，耗时长；
实际分析时普通每次只分析单个位点；
不一样引物退火温度不一样，需要探索。3.单核苷酸多态性（singlenucleotidepolymorphisms，SNP）AChromosomeMapofTomat