基因组的结构与功能PPT课件.ppt

基因组的结构与功能概念Genomedataforplantandanimalspecies概念第一节病毒基因组一病毒基因组核酸的主要类型二病毒基因组结构与功能的特点二病毒基因组结构与功能的特点三典型病毒基因组介绍1.SV40病毒基因组Earlygenes:expressedpriortotheonsetofviralDNAreplicationDNAVirusTranscriptionalCascadSV40Genome:CirculardsDNAFromFlintetal.PrinciplesofVirology(2000),ASMPressA2.乙型肝炎病毒基因组乙型肝炎病毒基因组结构和功能乙型肝炎病毒基因组结构和功能HBV基因组的结构和转录图谱HepadnavirusesandCaulimoviruses:DNAGenomesReverseTranscribedfroma+RNATemplateHepadnavirusReplication3.脊髓灰质炎病毒基因组3.脊髓灰质炎病毒基因组4.逆转录病毒(retroviruses)癌基因非编码区(2)前病毒基因组的转录和翻译(3)人类免疫缺陷病毒基因组HIV第二节原核生物基因组一原核生物基因组结构和功能的特点一原核生物基因组结构和功能的特点二质粒(plasmid)质粒的遗传控制质粒的遗传控制质粒的类型三转位因子(transposableelement)(一)转位因子的类型及特征转座子(Transposon,Tn)一类较大的转座成分,至少带有一个与转座作用无关并决定宿主菌遗传性状的基因。含转座酶
复合型Tn:由一个基因序列及两侧臂(IS序列或类IS序列)构成
TnA族Tn:两端有重复序列,中间有与Tn功能相关的基因及抗生素抗性基因
接合型Tn:G+菌中存在的一类可以在不同细菌间通过接合进行转移的Tn

(二)转位作用的机制2.复制性转座(有内解离区或res位点)转座作用机制四原核生物基因组研究及意义第三节真核生物基因组一真核生物基因组结构与功能特点一真核生物基因组结构与功能特点二真核生物基因组的结构OriginofCpG(CG)islandsOriginofCpG(CG)islandsBycontrast,theCGsequencesininactivegenesareusuallymethylatedtosuppresstheirexpression.ThemethylatedCmaybeconvertedtoTbyaccidentaldeamination.UnliketheCtoUmutationwhichisefficientlyrepaired,theCtoTmutationcanbecorrectedonlybythemismatchrepairwhichisveryinefficient.Hence,overevolutionarytimescales,themethylatedCGsequencewillbeconvertedtotheTGsequence.ThisexplainsthedeficiencyoftheCGsequenceininactivegenes.InheritanceoftheDNAmethylationpatternInheritanceoftheDNAmethylationpattern.(二)顺式调控元件顺式调控元件顺式调控元件GeneStructure(三)基因家族(genefamily)基因家族类型基因家族类型(四)重复序列(repeatsequence)重复序列类型(五)转座子Humantransposableelements(六)端粒(telomere)端粒酶(telomerase)三人类基因组的组织结构特点(一)人类基因组的重复序列(一)人类基因组的重复序列小卫星DNA微卫星DNA(一)人类基因组的重复序列RepeatcontentofthehumangenomeRepeatcontentofthehumangenomeClassesoftransposableelementsNumberofcopiesandfractionofgenomeforclassesofinterspersedrepeat(二)人类基因组中的多态性(二)人类基因组中的多态性PolymorphismPolymorphism四人类基因组计划简介(一)人类基因组作图(一)人类基因组作图(二)基因鉴定定位克隆ExamplesofdiseasegenesidentifiedbypositionalcloningInitialsequencingandanalysisofthehumangenomeInternationalHumanGenomeSeque