分子生物学基因组与比较基因组学ppt课件.ppt

一、基因组与基因组学1.基因组的概念2.基因组的种类与结构特点2.基因组的种类与结构特点（2）大小
基因组大小（genomesize）一般以单倍体基因组的核酸量来衡量，单位有pg（10-12g）、Dalton（道尔顿）、bp或kb、Mb等

1pg=6.02x1011Daltons=9.8x108bp生物的复杂程度与基因组大小的关系C值佯谬（C-ValueParadox）（3）类核基因组和核基因组的结构特点
类核基因组
环状；基因排列紧密，较少非编码序列：“streamlined”
核基因组
多线状；大小变化范围很大；有大量的非编码序列（重复序列、内含子等）（4）非编码序列（non-codingsequences）
非编码的重复序列（核基因组）
(a)局部分布的重复序列（localizedrepeatedsequences）
串联式（tandem）的高度重复序列（highlyrepeatedsequences）
(b)散布的重复序列（dispersedrepeatedsequences）
短的散布式重复序列（shortinterspersedelements,SINEs）
长的散布式重复序列（longinterspersedelements,LINEs）

内含子（intron）
I类（groupIintron）
II类（groupIIintron）
III类（groupIIIintron）
核mRNA内含子（nuclearmRNAintron），即剪接体
内含子（spliceosomalintron）
核tRNA内含子（nucleartRNAintron）
古细菌内含子（archaebacterialintron）
（5）细胞器基因组
线粒体基因组
在不同类型的生物（多细胞动物、高等植物、原生动物、藻类、真菌）中变化很大
多细胞动物：细小、致密
高等植物：复杂、不均一
原生动物、藻类、真菌：或偏向于动物型，
或偏向于植物型，但又有其各自的独特之处
2.基因组的种类与结构特点3.基因组学（Genomics）3.基因组学PhageX174:5375nt人类基因组计划遗传图物理图序列图转录图DNA的鸟枪法序列分析技术
结构基因组学的成就大大促进了生物信息学（bioinformatics）的发展
（2）功能基因组学（functionalgenomics）
大规模、高通量分析基因组中基因表达的技术
DNA芯片（DNAchip），即DNA微阵列（DNAmicroarray）
基因功能的分析
基因剔除（geneknockout）
对基因组中基因本身的认识（基因的概念）
编码蛋白质的基因
编码功能RNA的基因
非编码的DNA也可以是基因？

DNAmicroarray（3）进化基因组学（evolutionarygenomics）不同生物基因组中基因的平均密度

基因和基因组如何通过并非很多的基本结构单位（构件）的重组而进化成新的基因和基因组（构件在进化中被反复使用）

最原始的基因和基因组的起源，其后的进化模式与过程
4.蛋白质组学（proteomics）（3）蛋白质组学的研究技术
二维凝胶电泳（蛋白质的分离）
质谱（蛋白质的分析）

（4）后基因组学（post-genomics）
功能基因组学、蛋白质组学等
5.RNA组学（RNomics）usefulwebsitesofgenomics