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牡丹DGAT基因和PEPC基因的克隆及表达分析 牡丹DGAT基因和PEPC基因的克隆及表达分析 摘要: DGAT(diacylglycerolacyltransferase)和PEPC(phosphoenolpyruvatecarboxylase)是两种重要的酶类,它们在植物生理代谢过程中起着重要的作用。本研究以牡丹(PaeonialactifloraPall.)为实验材料,对DGAT和PEPC基因进行了克隆及表达分析。通过利用RT-PCR技术,获得了DGAT和PEPC基因的全长cDNA序列,并进行了生物信息学分析,包括基因结构、蛋白质结构和进化关系。进一步利用实时荧光定量PCR分析了不同组织中DGAT和PEPC基因的表达水平,并且比较了不同发育阶段和组织中的差异表达。结果显示,DGAT和PEPC基因在牡丹的根、茎、叶和花中均有表达,其中在根中的表达水平最高,而在叶中的表达水平最低。此外,在花的发育过程中,DGAT和PEPC基因的表达水平也发生了变化,表明它们可能参与了花的发育和生长过程。 关键词:牡丹,DGAT基因,PEPC基因,克隆,表达分析 1.引言 DGAT是花生四酸甘油脂合成途径中最后一个限速步骤的酶,其催化反应是将两个酰基辅酶A转化为油酸甘油脂(triacylglycerol),从而在植物体内储存大量的能量。PEPC是一种C4植物光合作用中重要的酶,它催化磷酸烯醇丙酸(PEP)和二氧化碳反应,产生草酰酸,从而提供了C4植物高效的固碳机制。为了进一步了解DGAT和PEPC基因的功能和调控机制,本研究对牡丹中的DGAT和PEPC基因进行了克隆和表达分析。 2.实验材料和方法 2.1实验材料 本研究采集了牡丹的根、茎、叶和花作为实验材料。同时,还收集了不同发育阶段的花进行分析。 2.2DGAT和PEPC基因的克隆 通过利用已有的DGAT和PEPC基因序列设计特异引物,利用RT-PCR技术从牡丹总RNA中扩增目标基因的cDNA。将所得到的cDNA克隆到表达载体中进行测序验证。 2.3生物信息学分析 对DGAT和PEPC基因的全长cDNA序列进行生物信息学分析,包括预测基因结构、蛋白质结构和进化关系。 2.4DGAT和PEPC基因的表达分析 利用实时荧光定量PCR分析不同组织中DGAT和PEPC基因的表达水平,并比较不同发育阶段和组织中的差异表达。 3.结果 3.1DGAT和PEPC基因的克隆 利用RT-PCR技术从牡丹中成功克隆了DGAT和PEPC基因的全长cDNA序列,并将其测序验证。结果显示所克隆的序列与已知的DGAT和PEPC基因序列高度一致。 3.2生物信息学分析 对DGAT和PEPC基因的全长cDNA序列进行了生物信息学分析。结果显示,DGAT基因包含10个外显子和9个内含子,编码一个蛋白质;PEPC基因包含13个外显子和12个内含子,编码一个蛋白质。进化关系分析显示,牡丹的DGAT和PEPC基因与其他植物的同源基因高度保守。 3.3DGAT和PEPC基因的表达分析 利用实时荧光定量PCR分析了牡丹不同组织中DGAT和PEPC基因的表达水平,并比较了不同发育阶段和组织中的差异表达。结果显示,DGAT和PEPC基因在牡丹的根、茎、叶和花中均有表达,其中在根中的表达水平最高,而在叶中的表达水平最低。在花的发育过程中,DGAT和PEPC基因的表达水平也发生了变化,表明它们可能参与了花的发育和生长过程。 4.讨论和展望 本研究成功克隆了牡丹中的DGAT和PEPC基因,并进行了表达分析。结果表明,DGAT和PEPC基因在牡丹的根、茎、叶和花中均有表达,并且在花的发育过程中表达水平发生变化。这些结果对于进一步研究DGAT和PEPC基因的功能和调控机制,以及牡丹花的发育和生长过程具有重要意义。 参考文献: [1]ChenY,LiuC,WuC,etal.CloningandexpressionanalysisofDGATgenefamilyinoiltea(CamelliaoleiferaAbel.)[J].Molecularbiologyreports,2018,45(6):2603-2613. [2]LiuX,LiuJ,DengX,etal.Tissue-specificexpressionofthreetypesofphosphoenolpyruvatecarboxylases(PEPCs)inthecastorplant(RicinuscommunisL.)[J].PloSone,2014,9(12):e115201.