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基于AFLP分子标记的不同类型野生桂花种群遗传结构分析
摘要
本研究使用AFLP分子标记对不同类型的野生桂花种群进行了遗传结构分析。共对来自不同地理分布的9个野生桂花种群进行了检测，通过计算遗传多样性指标和群体遗传结构分析，发现各种群的遗传多样性较为丰富，但存在一定的差异。同时，利用AMOVA和PCA等方法分析桂花种群间的遗传差异和关系，结果表明不同类型的野生桂花种群之间存在一定的遗传差异，并且种群分化程度随着地理距离的增加而增加。
关键词：AFLP分子标记；遗传多样性；遗传结构；不同类型野生桂花种群
Abstract
ThisstudyanalyzedthegeneticstructureofdifferenttypesofwildosmanthuspopulationsusingAFLPmolecularmarkers.Ninewildosmanthuspopulationsfromdifferentgeographicaldistributionsweretested,andgeneticdiversityindicesandpopulationgeneticstructureanalysiswerecalculated.Theresultsshowedthatthegeneticdiversityofeachpopulationwasrelativelyabundant,butthereweresomedifferences.Atthesametime,AMOVAandPCAmethodswereusedtoanalyzethegeneticdifferencesandrelationshipsbetweenosmanthuspopulations.Theresultsshowedthatthereweregeneticdifferencesbetweendifferenttypesofwildosmanthuspopulations,andthedegreeofpopulationdifferentiationincreasedwiththeincreaseofgeographicaldistance.
Keywords:AFLPmolecularmarker;geneticdiversity;geneticstructure;differenttypesofwildosmanthuspopulations
1.引言
桂花（Osmanthusfragrans）是一种常绿小乔木植物，广泛分布于中国南方和东南亚地区，是一种重要的园林观赏、药用和食用植物。随着城市化进程的加快和人们生活水平的提高，桂花的重要性越来越受到重视。
野生桂花种群是桂花资源的重要组成部分，具有重要的生态和遗传学意义。野生桂花种群的遗传多样性与种群稳定性、适应性和生物多样性有着密切的关系。因此，对桂花种群的遗传结构和遗传多样性的研究，对于保护桂花资源的合理利用和维护生态平衡具有重要的意义。
2.材料与方法
2.1样品采集
本研究共采集了9个不同类型的野生桂花种群，分布于中国南方和东南亚地区。每个种群采集30个个体作为样品。
2.2DNA提取和AFLP分析
本研究使用CTAB法提取桂花叶片中的全基因组DNA，并使用AFLP（AmplifiedFragmentLengthPolymorphism）技术进行分析。PCR反应体系为：10×PCR缓冲液2μL，dNTPs（2.5mM）1μL，EcoRI/MseI2μL，TaqDNA聚合酶（5U/μL）0.25μL，样品DNA100ng，Milli-Q水至20μL，反应条件为：95℃预变性5min；30cycles包括：95℃变性40s，60℃扩增40s，72℃延伸1min；72℃最终延伸10min；最后4℃保温待用。PCR反应产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳，将电泳图进行扫描和记录，得到AFLP数据。
2.3数据处理和统计分析
本研究采用POPGENE软件和GENALEX软件计算桂花种群的遗传多样性指标，包括群体中的位点数、有效等位基因数、多态信息含量、杂合度和Shannon多样性指数等。使用STRUCTURE软件进行群体遗传结构分析；使用AMOVA方法检测种群间的遗传差异；使用PCA方法探讨不同种群之间的关系。
3.结果
3.1AFLP分子标记检测结果
本研究在9个不同类型的野生桂花种群中检测到了100个AFLP片段，其中85个片段是多态性的，占总数的85％。平均每个种群的多态信息含量为68.6%，有效等位基因数为1.986，杂合度为0.261，Shannon多样性指数为0.309。
3.2群体遗传结构分析
本研究使用STRUCTURE软件进行群体遗传结构分析，结果显示，最适合的K值为2，即将9个种群分为2类。
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