基于AFLP标记的盐肤木种群遗传多样性和遗传结构的任务书.docx

基于AFLP标记的盐肤木种群遗传多样性和遗传结构的任务书
任务书
题目：基于AFLP标记的盐肤木种群遗传多样性和遗传结构
背景：
盐肤木（CortexMoutanRadicis）是中药材之一，是中国传统药材中非常重要的种类之一。盐肤木的生长范围十分广泛，但主要分布于黄土高原。在现代医学上，盐肤木也有重要的应用，主要用于抗菌、镇痛、镇痉和降血压等方面。
目前，盐肤木的资源正在逐渐减少。加之大量的盐肤木资源被过度采集，导致盐肤木的种群避免遗传多样性严重缺乏、遗传漂变加强，不仅对盐肤木的种群生长产生影响，还可能引起基因型的波动，影响药物的质量和疗效。因此，研究盐肤木种群的遗传多样性和遗传结构，对于保护盐肤木资源、维持其种群的稳定和促进其健康发展具有重要意义。
任务：
本次研究的任务是，基于AFLP标记技术，系统评估黄土高原盐肤木不同种群的遗传多样性和遗传结构，分析其种群的分化和遗传流动等因素，以期为盐肤木保护和管理提供科学依据。
具体任务如下：
1.收集样本
收集不同分布区域中的盐肤木样本，尽可能保证种群的样本来源广泛、数量充足。将不同来源的盐肤木样本编号，并重标记样本的出处和经纬度坐标。
2.DNA提取
按常规方法从所收集的盐肤木样本中提取基因组DNA，保证DNA的稳定性和高质量，以便进一步应用。
3.AFLP标记
通过AFLP（AmplifiedFragmentLengthPolymorphism）技术开展盐肤木样本的遗传多态性研究，该技术具有高分辨率和快速分析等优点。
4.遗传多样性分析
将AFLP标记的结果按照不同种群或不同产地进行聚类分析，建立遗传多样性树和聚类图，并计算种群间和整体的遗传多样性指标。
5.遗传结构分析
基于AFLP标记结果，分析不同盐肤木种群及其间的群体结构和遗传背景，重点研究一些重要基因型的分布特征、种群的分化历程和遗传漂变等因素。
6.保护管理建议
从研究的结果中得出结论，提出一些有针对性的保护管理建议，以保护盐肤木资源、维持其种群的稳定和促进其健康发展。
时间计划：
本次研究计划共历时12个月，大致安排如下：
第1-2个月：样品收集和基因组DNA提取
第3-6个月：AFLP标记和遗传多样性分析
第7-9个月：遗传结构分析和群体遗传学模拟
第10-11个月：数据分析和报告撰写
第12个月：完成报告审核、修改和书面提交。
参考文献：
1.Beja-Pereira,A.,etal.GeneticdifferentiationinthePortuguesegoatbreedsbasedonmicrosatellitesandmitochondrialDNA.GenetSelEvol.2003;35(4):421-44.
2.GoudetJ.Hierfstat,apackageforRtocomputeandtesthierarchicalF-statistics.MolEcolNotes.2005;5(1):184-86.
3.NeiM.MolecularEvolutionaandPhylogenetics.NewYork:ColumbiaUniversityPress,1987.
4.Peakall,R.andSmouse,P.GENALEX6:geneticanalysisinExcel.Populationgeneticsoftwareforteachingandresearch.MolEcolNotes.2006;6(1):288-295.
5.SokalR.R.,MichelC.B.Astatisticalmethodforevaluatingsystematicrelationships.UniversityofKansasScienceBulletin.1958;38(3):1409–38.