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肝癌血清核酸适配子的筛选及其鉴定 引言: 肝癌是最常见的恶性肿瘤之一,也是人类健康的主要威胁之一。目前,临床常用的诊断方法包括肝功能检测、超声、CT、MRI等影像学检查,以及组织病理学检测等。虽然这些方法能够对肝癌进行相对准确的诊断,但仍存在一定局限性。因此,开发一种可靠、敏感、快速的检测方法对于肝癌早期诊断非常重要。 血清核酸适配子(serummiRNA)是由血液中游离的miRNA组成的复杂混合物,体内生理状况的变化都能够影响血清miRNA的表达水平。我们猜测,血清miRNA中可能存在一些与肝癌相关的miRNA,发掘和筛选这些miRNA有助于肝癌的早期诊断。 本文的研究目的是对肝癌血清miRNA进行系统筛选和鉴定,探索它们在肝癌早期诊断中的应用价值。 材料与方法: 1、样本采集: 本研究共收集了来自肝癌患者与正常对照组的血清样本,其中肝癌组样本为病理证实的肝癌患者,正常对照组样本为健康人群。 2、RNA提取与纯化: 样本处理过程中采用商用血清miRNA提取试剂盒进行RNA提取和纯化。 3、miRNA测序: 将提取的RNA进行miRNA库构建,PCR扩增后进行IlluminaHiSeq2500测序。 4、数据分析: 对测序数据进行比对、归一化和注释分析,同时进行差异表达分析和分类模型分析。 5、检验方法: 将研究结果中得到的miRNA进行检验,包括qPCR、NorthernBlot、WesternBlot等。 结果: 1、miRNA筛选与差异分析: 通过测序,我们得到了大量的miRNA序列,对其进行注释后,筛选出了不同iallyexpressedmiRNA(DEmiRNA)。肝癌组和正常对照组之间的差异显著,差异表达的miRNA数量达数百个。通过对DEmiRNA进行KEGG通路富集分析,发现其中存在多个与肝癌相关的通路。 2、分类模型建立: 在研究中,我们进行了深度学习模型的建立,使用miRNA序列和差异表达数据,构建了一个深度神经网络模型(deepneuralnetwork)。该模型通过对miRNA的序列特征进行学习,预测肝癌诊断的准确性和敏感性都非常高。 3、miRNA鉴定: 通过qPCR、NorthernBlot、WesternBlot等检验方法,我们鉴定出了一批与肝癌相关的miRNA,包括miR-21、miR-122、miR-155、miR-224等。 讨论: 本研究通过血清miRNA测序技术,筛选出了一批与肝癌相关的miRNA,并鉴定出一部分特异性很高的miRNA。这些结果表明,肝癌血清miRNA具有很高的诊断和预测价值,有助于肝癌的早期诊断。 值得注意的是,我们还发现miRNA在不同阶段的表达情况有所不同。因此在未来的实际应用中,需要综合考虑不同miRNA的表达水平,建立更为准确的检测模型。 结论: 本研究的结果表明,肝癌血清miRNA具有很高的诊断和预测价值,有助于肝癌的早期诊断。我们鉴定出的一批特异性很高的miRNA,有望成为肝癌的可靠标志物。未来我们还需进一步完善检测方法、提高检测的准确性和精确度,为肝癌的早期诊断和治疗提供更加有效的手段。