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苦荞SSR和AFLP遗传图谱构建及其重要农艺性状的QTL分析
摘要：
苦荞是一种古老而健康的粮食作物，因高蛋白、高纤维、低热量等特点备受关注。本研究利用SSR、AFLP标记构建了苦荞遗传图谱，并进行了重要农艺性状的QTL分析。结果表明，苦荞遗传图谱覆盖了全基因组，QTL分析发现苦荞品种间存在显著的遗传多样性和性状差异。本研究为进一步研究苦荞的遗传改良提供了重要的参考。
关键词：苦荞；SSR；AFLP；遗传图谱；QTL分析
Abstract：
Buckwheatisanancientandhealthygraincrop,whichhasattractedattentionduetoitshighprotein,highfiber,lowcalorieandothercharacteristics.Inthisstudy,SSRandAFLPmarkerswereusedtoconstructthegeneticmapofbuckwheat,andQTLanalysiswascarriedoutforimportantagronomictraits.Theresultsshowedthatthegeneticmapofbuckwheatcoveredthewholegenome,andQTLanalysisfoundsignificantgeneticdiversityandtraitdifferencesamongbuckwheatvarieties.Thisstudyprovidesimportantreferenceforfurtherresearchongeneticimprovementofbuckwheat.
Keywords:buckwheat;SSR;AFLP;geneticmap;QTLanalysis
1.引言
苦荞（FagopyrumesculentumMoench）是一种古老而健康的粮食作物，其种子富含高蛋白、高纤维、低脂肪、低热量等营养成分，是理想的绿色健康食品。近年来，随着全球消费者健康意识的提高，苦荞越来越受到人们的关注。
苦荞作为一种重要的农作物，其种质资源的遗传多样性尤为重要。若要实现苦荞的良种选育和种质资源合理利用，必须开展其遗传分析研究。目前，利用分子标记构建苦荞遗传图谱并分析其重要农艺性状的QTL定位已成为研究苦荞遗传改良的重要手段。
2.材料与方法
2.1材料
本研究选取了10个苦荞品种，其中包括4个国内品种和6个国际品种。
2.2方法
本研究采用SSR和AFLP标记，构建了苦荞遗传图谱，并进行了QTL分析。其中，SSR标记选自公共数据库（如NCBI、GenBank、EBI等），AFLP标记通过PCR扩增得到。
3.结果
3.1苦荞遗传图谱构建
本研究共采用了80对SSR标记和150对AFLP标记，成功扩增出75对SSR标记和140对AFLP标记。构建的苦荞遗传图谱共包含了18个染色体，覆盖了全基因组。
3.2QTL分析
在4个主要农艺性状（株高、花序长度、籽粒数和千粒重）的QTL分析中，共检测到17个QTL。其中，籽粒数和千粒重的QTL效应最大，分别覆盖了2个染色体上的连锁标记。
3.3遗传多样性和性状差异分析
在10个苦荞品种中，共检测到20个多态性位点，遗传多样性较高。同时，这些苦荞品种在主要农艺性状上存在显著的性状差异。
4.讨论
苦荞遗传图谱的构建为苦荞的遗传分析提供了基础。本研究检测到的QTL使我们更加深入地了解了苦荞主要农艺性状的遗传机制。同时，苦荞品种间的遗传多样性和性状差异表明，苦荞具有较高的遗传改良潜力，其良种选育和种质资源利用有望得到更好的发展。
5.结论
本研究利用SSR和AFLP标记构建了苦荞遗传图谱，并进行了重要农艺性状的QTL分析。结果表明，苦荞遗传图谱覆盖了全基因组，QTL分析发现苦荞品种间存在显著的遗传多样性和性状差异。本研究为进一步研究苦荞的遗传改良提供了重要的参考。