黄瓜SSR遗传图谱的构建及黄瓜重要农艺性状的QTL定位.pdf

摘要

黄瓜(CucumissativusL.)是我国的重要蔬菜作物，培育高产、优质、多抗的新品种是黄瓜育种
者的共同目标。分子标记辅助选择(MAS)育种技术的应用，极大地加速了育种进程。而高效的MAS
技术依赖于饱和的遗传图谱和农艺性状的准确定位，因此，黄瓜饱和遗传图谱的构建和性状准确
的QTL定位越来越被重视。本研究以黄瓜野生变种PI183967(CucumissativusL.hardwickii)和新

泰密刺选系931为亲本，建立了包含179个单株的F2分离群体，利用SSR标记技术，构建了一张

较饱和的黄瓜SSR遗传图谱，并结合对F2群体及F2:3家系主要农艺性状的调查结果，对黄瓜瓜长、
瓜瘤大小、瓜刺密度、瓜纹密度、第一分枝节位、第一雌花节位进行了QTL定位分析。具体结果
如下：
(1)利用来源于黄瓜全基因组序列的2112对SSR引物，对亲本进行筛选，得到996对有多态
性的引物，多态率为47.2%，结合本所已经发表的黄瓜SSR高密度遗传图谱，对996对多态性引

物进行有目的性地选择，挑选出319对SSR引物，以包含179个单株的F2群体为作图群体，构建
了野生黄瓜SSR遗传图谱，该图谱包含234个SSR标记、7个连锁群，图谱覆盖基因组长度829.7
cM，平均图距3.5cM，标记分布均匀，不存在较大的间隙。与黄瓜高密度遗传图谱进行比较后，
确定了7个连锁群与黄瓜7条染色体的对应关系。

(2)分别对F2群体及F2:3家系的瓜长、瓜瘤大小、瓜刺密度、瓜纹密度、第一分枝节位、第一
雌花节位进行了调查，利用本研究构建的SSR遗传图谱，对这些性状进行了QTL定位研究。共

检测到19个QTLs(F2代9个，F2:3家系10个)，其中，瓜长检测到的QTLs最多，为5个；瓜刺
密度fsd6.2的贡献率最大，为32.5%；每个性状都至少能检测到1个贡献率大于10%的主效QTL
位点，共检测到主效QTL位点12个；存在不同性状QTL聚集的现象，如fmd1.1和fws1.1均定
位在了1号染色体的SSR16671(65.2cM)～SSR15739(74.5cM)之间、第一分枝节位QTLflbn1.2和
瓜纹密度QTLfmd1.2均定位在1号染色体的SSR12719(125cM)～SSR04986(134.8cM)之间；存在
高效稳定的QTL位点：fsd6.1和fsd6.2，结合与其紧密连锁的SSR标记(SSR15802和SSR17133)，
可将其用于黄瓜的分子辅助育种。
本研究构建的黄瓜SSR遗传图谱上有148对标记与已发表的黄瓜高密度图谱上的标记不同，
结合已经发表的高密度图谱，可以构建一张更为饱和的、定位了相关性状的遗传图谱；同时确定
了连锁群和染色体的对应关系，本研究第一次实现了将黄瓜主要农艺性状(瓜长、瓜瘤大小、瓜刺
密度、瓜纹密度、第一分枝节位、第一雌花节位)的QTL定位到染色体上，从而为黄瓜分子标记
辅助育种提供了直接的依据。

关键词：黄瓜，SSR，遗传图谱，QTL

Abstract

Cucumber(CucumissativusL.)isoneofthemostimportantvegetablecropsworldwide.Highyield,
goodquality,andmulti-resistancearethemaintargetsforcucumberbreeding.Applicationofmarkers
assistantselection(MAS)incucumberbreedingcanimproveefficiencygreatlyandshortenbreeding
cycles.BecauseofhighefficiencyMAStechnologyrelyingonthesaturatedgeneticmapandaccurate
geneticmappingofagronomictraits,constructionofsaturatedgeneticmapandQTLanalysisfor
cucumber’sagronomictraitsaremoreandmoreconcerned.Inthisstudy,acucumberSSRgeneticmap
wasconstructedusingawidecrossPI183967×931.BasedonthisSSRmap,QTLanalysiswas
conductedforsixagronomictraitsincludingfruitlength,thefirstbranchnode,thefirstfemalenode,size
offruitwarts,densi