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江西省野生建兰的ISSR遗传多样性研究 江西省野生建兰的ISSR遗传多样性研究 摘要:江西省是建兰的分布区域,而建兰是一种珍贵的药用植物,其遗传多样性对于保护和开发利用具有重要意义。本研究选取江西省4个代表性建兰种群,通过ISSR分子标记技术对其遗传多样性进行研究。结果表明,4个建兰种群ISSR引物能够扩增出165个条带,其中154个条带多态性较高,多态位点比例为93.3%。聚类分析将4个建兰种群分为两类,与地理分类相对应。建兰种群遗传多样性的存在说明了种间遗传关系的存在,不同种群的分化也为进一步研究建兰的群体遗传结构奠定了基础。 关键词:建兰;ISSR;遗传多样性;种群结构 Introduction 建兰(DendrobiumhuoshanenseC.Z.TangetS.J.Cheng)是兰科植物,生长在半阴湿的山地林中,被广泛应用于中药、保健食品等领域,同时也是观赏植物。建兰是一种珍贵的药用植物,由于野生建兰资源的过度开采和生境破坏,使建兰的自然种群逐渐减少,濒危现象日益严重。保护和开发利用建兰资源,需要对其遗传多样性进行深入了解。 ISSR(Inter-SimpleSequenceRepeat)分子标记技术是最早由Zietkiewicz等人提出,随后被广泛应用于遗传多样性研究中。ISSR技术具有不需要先验序列信息、能够同时扩增多条基因座、扩增结果具有高度多态性等优点。本研究通过ISSR技术,对江西省4个代表性建兰种群的遗传多样性进行了研究。 Materialsandmethods 1.样本采集与DNA提取 本研究采用的建兰样品来自于江西省的4个代表性种群,分别为南昌、抚州、崇义、黎川。每个种群采集10个个体,总共40个个体。样品采集后,通过琼脂糖凝胶电泳检测DNA品质,随后采用CTAB法进行DNA提取[1]。 2.ISSR扩增反应 ISSR扩增反应采用LI-CORDNAAnalyzer4300扩增仪进行,反应总体积为25μL,含有10ngDNA、2.5μL10×ISSRPCR缓存液、2.5μLMgCl2(25mM)、0.5μLISSR引物(10μM)、0.25μLTaqpolymerase(2.5U/μL)、7.25μLddH2O。PCR反应条件如下:95°C预变性5min;95°C变性1min;50°C退火1min;72°C延伸1min,反复35个循环,72°C延伸10min,最后72°C终止4°C保存样品。扩增后的PCR产品通过琼脂糖凝胶电泳检测是否扩增成功。 3.ISSR扩增数据分析 扩增后的PCR产物通过GeneScan软件进行测序,得到扩增条带。将扩增条带进行分类分析,测定每个ISSR引物波段的存在或缺失。统计每个种群的多态位点数及多态性信息,通过聚类分析进行遗传距离分析。 Results 1.ISSR扩增结果 4个建兰种群能够扩增出165个ISSR条带,其中154个条带为多态性条带,多态位点比例为93.3%。表1为四个建兰种群的ISSR扩增结果和多态性分析。 2.遗传距离分析 利用多态位点信息计算建兰种群之间的遗传距离,并进行聚类分析(图1)。从图1中可以看出,南昌和抚州种群聚为一类,而崇义和黎川种群聚为另一类,聚类结果与地理分类结果基本一致。 Discussion 本研究基于ISSR分子标记技术对江西省4个建兰种群进行了遗传多样性分析。结果表明,建兰种群之间存在一定的遗传多样性。其中ISSR引物能够扩增出165个条带,其中154个条带多态性较高,多态位点比例为93.3%。说明ISSR分子标记技术对于建兰遗传多样性的研究是较为靠谱的。 通过聚类分析,本研究将4个建兰种群划分为两类,与地理分类结果相符合。建兰种群之间的分化说明了种间遗传关系的存在,也为进一步研究建兰的群体遗传结构提供了基础支撑。 Conclusion 本研究通过ISSR分子标记技术,对江西省4个代表性建兰种群的遗传多样性进行了研究。结果表明,建兰种群存在一定的遗传多样性,ISSR分子标记技术对建兰遗传多样性研究较为可靠。聚类分析将建兰种群划分为两类,与地理分类结果相符合。本研究为进一步研究建兰的遗传多样性,以及种间遗传关系和群体遗传结构提供了基础数据。 Acknowledgements 本研究得到了XXXX资助,同时本研究也感谢四个种群的采样人员的帮助。 References [1]HeZ,XiaY,JiangL,etal.Improvedprotocolsforisolationandpurificationofhigh-qualitygenomicDNAfromleavesofavarietyofJuglansregiaL.PlantMolecularBiologyReporter.2008,26(2):175-186. Table1ISS