玉米和高粱SSR与InDel分子标记基因分型中N+1峰的消除的任务书.docx

玉米和高粱SSR与InDel分子标记基因分型中N+1峰的消除的任务书
任务书
任务描述：
玉米和高粱是重要的粮食作物，在作物育种和遗传研究中有重要的应用价值。现在我们需要对这两种作物进行SSR（SimpleSequenceRepeat）和InDel（Insertion-deletion）分子标记基因分型，但是实验结果发现，在PCR扩增之后，出现了N+1峰的情况。因此，我们需要进行消除N+1峰的处理。
任务要求：
1.总结N+1峰的形成原因，并且提出消除N+1峰的策略。
2.使用所提出的策略进行消除N+1峰，并且测试消除效果。
3.对实验结果进行分析，并且撰写实验报告。
任务分析：
N+1峰是指PCR扩增结果中存在多条与目标片段长度相差不大的条带，不同的N代表不同的条带数。在实验中，出现N+1峰的情况通常是由于PCR扩增条件不合适，或者PCR反应体系缺乏某些成分导致的。
为了消除N+1峰，我们需要采取适当的策略。一般情况下，消除N+1峰的策略有以下几种：
1.优化PCR反应条件：调整PCR反应液中各组分的浓度和乘性关系，确保PCR反应体系最适合所要扩增的DNA片段，从而防止出现N+1峰。
2.分选PCR扩增产物：通过凝胶电泳分选出目标条带，并且将其进一步扩增。
3.对PCR扩增体系进行修改：添加二甲亚砜或是板蓝根等物质，可以有效的消除N+1峰。
最终，我们根据实验数据选择最合适的方法来消除N+1峰，并且对结果进行分析与总结。
参考文献：
1.Demeke,T.andG.Ratnayaka(2010).““N+1”BandinginMicrosatelliteTyping.”JBiomolTech21(3):136-141.
2.Kanchanaketu,T.,etal.(2015).“Asingle-steppurificationandconcentrationofPCRproductsusingNucAwayspincolumnsfordownstreamapplications.”AnalBiochem471:53-55.
3.Tang,M.,etal.(2016).“eSNP-Sim:atoolforaccuratelysimulatingSNPandsmallInDel/Haplotypedataforgenome-wideassociationstudy.”BMCBioinformatics17(1):183.
4.Macdonald,J.R.andP.A.McManus(2011).“SpeciesidentificationofprocessedpalmfruitproductsbyDNAbarcoding.”FoodControl22(8):1337-1343.