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甜叶菊高密度遗传图谱构建及其分子标记筛选的开题报告
一、研究背景及意义
甜叶菊是一种天然无卡路里的甜味剂，已被广泛用于食品、饮料和药品等领域。然而，目前市场上常见的甜叶菊产品多为化学合成甜味剂，无法满足人们对天然、健康的需求，因此开发甜叶菊的高产量、高品质的栽培品种是非常必要的。
基因组学研究提供了一种快速、高通量的筛选新品种的方法，特别是基于分子标记的筛选，可以避免传统育种方法耗时耗力的缺点。目前已经有一些甜叶菊基因组数据被公布，但甜叶菊的高密度遗传图谱及分子标记筛选方面的研究目前还相对较少，因此本研究旨在构建甜叶菊高密度遗传图谱，通过这个图谱进行分子标记筛选，为今后的甜叶菊品种改良提供基础数据。
二、研究目的
本研究目的在于构建甜叶菊的高密度遗传图谱，利用该遗传图谱进行分子标记筛选，以寻找出潜在的甜叶菊品种改良的关键基因，为今后的品种改良提供基础数据。
三、研究内容及技术路线
1.甜叶菊DNA提取和建库
以宿根紫菜（Porphyraumbilicalis）CGI反应文库构建技术为基础，利用IlluminaHiSeq2000测序，得到甜叶菊基因组和转录组的深度覆盖。
2.遗传图谱构建
选择二倍体的甜叶菊自交系进行遗传图谱构建，采用GBS技术对其进行SNP分析，从而建立甜叶菊的高密度遗传图谱。
3.分子标记筛选
利用甜叶菊的高密度遗传图谱，从中筛选出具有优良甜味特点的相关基因的分子标记。
4.数据分析和确认
通过头部比对和SNP分析等数据分析方法，对构建的遗传图谱和筛选出的分子标记进行确认，进一步筛选出最佳的候选品种。
四、研究预期及意义
通过本研究，能够构建起甜叶菊高密度遗传图谱，实现分子标记筛选，找到潜在的基因突变关系，为今后的甜叶菊品种改良提供基础数据。甜叶菊是一种广泛应用的甜味剂，其市场前景非常广阔。将从分子水平上理解其遗传本质和形成机制，为其培育改良提供技术保障，有着应用实践和经济效益的双重意义。