基于SSR标记甘薯种质指纹图谱的构建及遗传多样性分析的任务书.docx

基于SSR标记甘薯种质指纹图谱的构建及遗传多样性分析的任务书
任务书
题目：基于SSR标记甘薯种质指纹图谱的构建及遗传多样性分析
研究背景：
甘薯（IpomoeabatatasL.）是世界上重要的粮食作物之一，主要分布在热带和亚热带地区。甘薯因其丰富的营养价值和适应性广、产量高等优点，已经成为了世界上重要的经济作物之一。然而，甘薯遗传多样性受到严重的丧失和缺乏，给甘薯育种的发展带来了一定的困难。
为了挖掘甘薯种质资源的遗传多样性，本研究拟利用SSR标记技术建立甘薯的种质指纹图谱，并对其进行遗传多样性分析。
研究内容：
1.选择适当的甘薯种质，建立甘薯的种质收集库。
2.对甘薯品种进行SSR标记技术的PCR扩增和聚合物凝胶电泳分析，建立甘薯的种质指纹图谱。
3.基于建立的物种指纹图谱，对甘薯种间和种内的遗传多样性进行分析，包括遗传多样性指数计算、聚类分析、主成分分析等。
4.探究甘薯种质资源在遗传多样性层面上的特征和形成原因,并探讨如何对甘薯遗传多样性进行保护和利用。
研究方法：
1.选择适宜的甘薯种质，对不同的甘薯品种进行DNA提取和PCR扩增反应。
2.采用SSR标记技术，在聚合物凝胶电泳上观察甘薯种质扩增产物的大小变化，建立种质指纹图谱和构建遗传多样性数据库。
3.利用统计软件，计算遗传多样性指数（如Shannon-Wiener多样性指数、等位基因数、杂合度等），并分析甘薯种质资源的遗传多样性特征。
4.利用聚类分析法、主成分分析法等数学统计方法对甘薯种质资源进行聚类分析和分类，探究甘薯种间和种内的遗传多样性特征。
预期成果：
1.建立甘薯种质指纹图谱，提供甘薯遗传多样性分析的重要工具。
2.揭示了甘薯种质资源在遗传多样性层面上的特征和形成原因，为甘薯育种提供可靠的基础研究数据。
3.探讨如何保护和利用甘薯遗传多样性，为促进甘薯遗传多样性保护和育种提供科学依据。
参考文献：
1.窦梅，李华，王国华等.一种基于SSR标记技术的甘薯种质指纹图谱构建方法[J].作物学报，2011，37(4):692-698.
2.舒静雅,李华静,朱恩辞.中国甘薯种质资源遗传多样性研究[J].作物学报，2002，28(4):596-602.
3.李秋华,洪政伟,胡泉源等.甘薯品种遗传多样性分析[J].南方作物多样性，2009，1(1):19-25.