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高原鼢鼠和甘肃鼢鼠MDM2转录调节及p53甲基化分析的任务书 任务书 任务:对高原鼢鼠和甘肃鼢鼠的MDM2转录调节及p53甲基化进行分析 背景: 高原鼢鼠和甘肃鼢鼠是我国青藏高原特有的高寒区域小型哺乳动物,具有耐低氧、抗寒冷、耐旱和耐高原紫外线辐射等特殊适应性。p53是一个重要的转录因子,在DNA损伤和细胞凋亡等过程中发挥着重要的作用。而MDM2则是p53的负调控因子,可以降解p53,起到对p53的抑制作用。近年来,研究发现p53的调控和调节与热量、氧化损伤、低氧等有关,而这些正是高原鼢鼠和甘肃鼢鼠所面临的生存压力。因此,研究高原鼢鼠和甘肃鼢鼠的p53的调控和调节机制对于深入探究这两种特殊动物的适应性机制具有重要意义。 任务描述: 1.收集高原鼢鼠和甘肃鼢鼠的组织样本,进行RNA和蛋白质提取。 2.对RNA样本进行定量PCR,分析MDM2转录水平的变化。对蛋白质样本进行Westernblot分析,分析MDM2水平的变化。 3.对RNA样本进行转录组测序,并进行基因差异表达分析,筛选出与p53调节相关的基因。 4.对筛选出的基因进行GO分析和KEGG通路分析,探究参与p53调节的关键基因及其通路。 5.对筛选出的关键基因进行p53的甲基化分析,研究p53的表观遗传调控机制。 6.分析高原鼢鼠和甘肃鼢鼠的p53调控机制的异同,探究两种特殊动物的适应性机制差异。 7.将以上实验结果进行统计分析和综合分析,撰写研究报告。 要求: 1.实验中的样本应该来源于多个个体,样本数不得少于5个。 2.实验中的各项数据应该进行统计分析和图表化处理。 3.研究报告应该具有可读性和科学性,详细描述实验中的操作过程和结果。 4.研究报告中应该有明确的结论和建议,提出下一步研究工作的方向。 参考文献: 1.JordanJJ,MenendezD,IngaA,NoureddineM,BellDA,ResnickMA:NoncanonicalDNAmotifsastransactivationtargetsbywildtypeandmutantp53.PLoSGenet2008,4:e1000104. 2.LiQ,ZhangY,ZhangX,WangS,LiuJ,DaiY,WangY:PKC-mediatedphosphorylationofMDM2atserine166inesophagealsquamouscellcarcinomas.CancerLett2009,274:317-326. 3.Miranda-VizueteA,DamdimopoulosAE,SpyrouG:Themitochondrialthioredoxinsystem.AntioxidRedoxSignal2011,13:1149-1163. 4.MohammadRM,Al-KatibA,PettitGR,WallNR,HadiSM:PotentiationoftheantimyelomaactivityofanisomycinthroughdegradationofMDM2.Blood2002,99:380-388. 5.Wild-typep53protein:BindingofproteinkinaseCKIIandthegrowthsupressionofMCF-7humanbreastcancercells.CancerRes1999,59:1452-1457.