基于转录组水平的枣疯病发病机理研究的开题报告.docx

基于转录组水平的枣疯病发病机理研究的开题报告
一、选题背景
枣疯病是枣树上一种由金花菜单胞菌（Erwiniacarotovorasubsp.carotovora）引起的细菌性病害，其发病率相当高，在我国西北地区常常影响枣树的生长和发展，浪费了大量的劳力和财力。目前，对枣疯病的发病机理研究还不够深入，仍需进一步探究其具体的发病机制，为治疗和预防枣疯病提出理论基础。
二、研究目的
本研究旨在基于转录组水平对枣疯病的发病机理进行深入的解析，通过分析受到Erwiniacarotovorasubsp.carotovora感染的枣树与未感染的对照枣树之间的转录组差异，探究枣疯病的关键基因及其参与的途径，从而为枣疯病的治疗提供新的理论基础和辅助手段。
三、研究内容
1.构建感染Erwiniacarotovorasubsp.carotovora的枣株转录组文库。
2.对文库进行高通量测序，得到大量的RNA测序数据。
3.对得到的RNA测序数据进行拼接、处理、过滤和比对，筛选出差异表达的基因。
4.对差异表达基因进行生物信息学分析，包括KEGG、GO等，揭示参与枣疯病发病过程的关键基因及其生物学途径。
5.对筛选出的关键基因进行RT-PCR验证。
四、预期成果
本研究将通过分析感染Erwiniacarotovorasubsp.carotovora的枣树与未感染的对照枣树的转录组差异，揭示枣疯病发病的关键基因及其参与的生物学途径，为枣疯病的治疗提供新的理论基础和辅助手段。同时，本研究还将构建感染Erwiniacarotovorasubsp.carotovora的枣株的转录组文库，并进行高通量测序，为今后的相关研究提供数据基础。
五、研究意义
本研究通过分析Erwiniacarotovorasubsp.carotovora对枣树的感染，揭示了枣疯病发病的关键基因及其参与的途径，对于今后的相关研究和治疗提供了理论基础和参考依据，同时也具有重要的应用价值。