基于转录组水平的枣疯病发病机理研究的任务书.docx

基于转录组水平的枣疯病发病机理研究的任务书
任务书
项目名称：基于转录组水平的枣疯病发病机理研究
任务目的：探究枣疯病的发病机理，分析其影响因素，为枣疯病的防治提供依据与参考。
任务内容：
一、针对国内外枣疯病发病机理研究现状以及病原微生物类型和传播途径等方面进行文献调研。
二、选择正常和枣疯病患者的枣叶样品进行RNA采集、转录组测序以及数据分析和挖掘。
三、对转录组数据进行差异表达基因筛选和功能富集分析，以获得枣疯病发病机理方面的相关信息。
四、基于转录组水平探究枣疯病的发病机理，分析其影响因素，包括环境因素和遗传因素等。
五、撰写研究报告，阐述研究发现和结论，提供与枣疯病防治相关的建议和措施。
任务计划：
一、文献调研：在任务开始前一个月内完成。
二、样品采集：选择枣叶健康、枣叶枯黄、枣叶发生疯病三组样品，每组样本不少于5份，共计15份样品采集和处理。采样时间于8月底至9月初进行。样品处理于任务开始后两周内完成。
三、RNA采集和转录组测序：在样品处理完成后的两周内完成。选择RNA浓度和质量充足的样本进行测序，预计每组样本测序数据量在10G以上。
四、数据分析和挖掘：在测序数据获取后的两个月内完成。对测序数据进行质控、比对、差异表达基因筛选和功能富集分析等处理。
五、分析结果整理和报告编写：在数据分析和挖掘结束后的一个月内完成。制作报告正式汇总和阐述研究发现和结论，提出建议和措施。
任务实施：
任务实施由以下人员共同完成：
一、项目主持人：对任务的总体规划和实施负责，主持任务各阶段的工作，协调沟通任务内容。
二、实验室助理：协助项目主持人采集、处理样品，协助分析数据和整理成果。
三、数据分析专家：熟练掌握转录组数据分析和挖掘工具，负责对测序数据进行处理和分析，挖掘关键信息。
四、科研人员：协助任务主持人完成文献调研、报告撰写等工作。
任务成果：
本任务将以研究报告形式呈现成果，报告应包含以下内容：
一、研究背景和目的；
二、病理病原微生物相关综述；
三、转录组数据分析和差异基因筛选结果；
四、差异基因的功能富集分析和通路分析结果；
五、枣疯病发病机理分析和影响因素探究；
六、结论和建议。
报告字数不少于4000字。
任务预算：
本任务主要涉及采样、测序、分析等方面，预算如下：
一、样品采集和处理：5000元；
二、RNA采集和转录组测序：80000元；
三、数据分析和挖掘：20000元；
四、设备购买和耗材支出：30000元。
总计消费：135000元。