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烟草分子遗传连锁图谱的构建的任务书 任务书: 题目:烟草分子遗传连锁图谱的构建 任务背景: 烟草是世界上最普遍的农作物之一。作为工业和农业产品,烟草的需求不断增加。烟草产业也因此发展迅速,为经济的增长做出了不可替代的贡献。然而,烟草植物生长周期长,生物学特性复杂,如何加快烟草育种的进程,并提高烟草的品质和产量,是烟草学界一直以来的研究重点。 烟草分子遗传连锁图谱被广泛应用于烟草遗传改良和烟草基因靶向工程,可加快烟草育种的进程。烟草分子遗传连锁图谱被定义为覆盖烟草基因组的一组分子标记,这些标记与可测量的表型特征相关联,通过它们可以分析烟草基因组的特征和组合,并获得对烟草形态、生长和品质等方面的深入理解。 任务目的: 本任务旨在构建烟草分子遗传连锁图谱,为烟草遗传改良和烟草基因靶向工程提供基础数据,促进烟草产业的进一步发展。 任务内容: 1.获取烟草基因组的高质量DNA样本,并进行测序; 2.设计、合成和标记分子标记,如SSR、SNP等; 3.构建、筛选合适的经常性接合种群(如F2或后代回交种群),以进行连锁分析; 4.利用基础分子标记进行遗传图谱的构建; 5.评估分子遗传图谱的质量,根据需要进行后续修正和更新; 6.应用遗传图谱进行烟草品种间、种群间的遗传关系分析,并进行群体遗传结构分析; 7.分析烟草品种重要农业特征(如产量、品质等)的遗传基础; 8.利用分子遗传图谱,筛选适宜的种质资源进行烟草育种。 任务步骤: 1.烟草基因组测序:获取高质量、高覆盖度的烟草基因组测序数据; 2.标记分析:基于烟草基因组测序数据,进行简单序列重复(SSR)和单核苷酸多态性(SNP)分析和标记设计; 3.种群筛选:选择适宜的F2或回交种群进行连锁分析,同时收集大量种质资源; 4.连锁分析:通过收集样品的分子标记数据,进行遗传连锁分析,构建连锁图谱; 5.质量评价:对分子图谱进行深入评估和优化,确保结果准确可靠; 6.种质筛选:通过分析遗传连锁图谱和种质资源,筛选适宜的烟草种质资源进行育种; 7.应用分析:应用构建的烟草分子遗传连锁图谱,在遗传级别上分析和解释烟草的生长和品质特征; 8.结果总结:对研究结果进行总结和归纳。 任务成果: 任务完成后,将获得烟草分子遗传连锁图谱。该图谱能够提供烟草基因组的高分辨率和遗传结构信息。同时,该任务还将提供烟草育种和生产的一系列资源和方法。 1.研究报告:包括论文、手册和其他相关文献,对任务的主要结果予以归纳总结; 2.烟草分子连锁遗传图谱数据:具体数据见相关论文、手册,包括分子标记数据、遗传图谱数据和种质资源评价结果。 参考文献: 1.Leitch,I.J.,Hanson,L.,Lim,K.Y.,Kovarik,A.,Chase,M.W.,&Clarkson,J.J.(2008).TheupsanddownsofgenomesizeevolutioninpolyploidspeciesofNicotiana(Solanaceae).AnnBot,101(6),805-814. 2.Frary,A.,Nesbitt,T.C.,Frary,A.,Grandillo,S.,vanderKnaap,E.,Cong,B.,...Tanksley,S.D.(2000).fw2.2:aquantitativetraitlocuskeytotheevolutionoftomatofruitsize.Science,289(5476),85-88. 3.Huang,X.,Feng,Q.,Qian,Q.,Zhao,Q.,Wang,L.,Wang,A.,...Han,B.(2009).High-throughputgenotypingbywhole-genomeresequencing.GenomeRes,19(6),1068-1076. 4.Liu,K.,&Muse,S.V.(2005).PowerMarker:integratedanalysisenvironmentforgeneticmarkerdata.Bioinformatics,21(9),2128-2129. 5.Peakall,R.,&Smouse,P.E.(2012).GenAlEx6.5:geneticanalysisinExcel.Populationgeneticsoftwareforteachingandresearch--anupdate.Bioinformatics,28(19),2537-2539.