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麻疯树脂肪酸碳链延伸关键基因的克隆及功能分析的任务书 任务书 题目:麻疯树脂肪酸碳链延伸关键基因的克隆及功能分析 一、任务背景及意义 麻疯树(JatrophacurcasL.)是一种重要的油料植物,其油脂富含不饱和脂肪酸,具有很高的工业应用价值。但是,麻疯树油脂中长链高度不饱和脂肪酸(例如C18:2和C18:3)含量较低,因而限制了麻疯树作为油料植物的开发和利用。 长链脂肪酸的合成是通过脂肪酸碳链延伸的过程实现的。该过程由一系列基因编码的酶催化,包括乙酰辅酶A羧化酶(ACCase)、3-羧基酰基载体蛋白减氢酶(3-Ketoacyl-ACPreductase,KAR)、3-羧基酰基载体蛋白酰化酶(3-ketoacyl-ACPsynthaseII,KASII)、β-羟基酰基载体蛋白脱水酶(β-hydroxyacyl-ACPdehydratase,HAD)和酰基载体蛋白还原酶(enoyl-ACPreductase,ENR)。因此,通过对麻疯树长链脂肪酸合成相关的基因进行分析,有望揭示麻疯树合成高含量长链脂肪酸的分子机制,为麻疯树油料利用提供基础支撑。 二、任务目标 本次任务旨在克隆麻疯树长链脂肪酸碳链延伸关键基因,并对其进行功能分析。具体包括以下目标: 1.通过BLAST算法进行麻疯树转录组或基因组测序数据分析,筛选出麻疯树长链脂肪酸碳链延伸关键基因家族成员。 2.利用克隆技术,从麻疯树基因组或cDNA文库中克隆出麻疯树长链脂肪酸碳链延伸关键基因家族成员全长序列。 3.应用生物信息学工具对克隆出的基因家族成员的基本结构特征、亲缘关系、进化历史等进行分析。 4.基于qPCR等方法,探究麻疯树长链脂肪酸碳链延伸关键基因的组织表达特点。 5.应用CRISPR/Cas9或RNAi等技术对麻疯树长链脂肪酸碳链延伸关键基因进行功能研究,验证该基因在麻疯树长链脂肪酸的合成中的作用。 三、任务进度及要求 本次任务周期为6个月。其中,前3个月主要用于麻疯树基因组或cDNA文库的测序分析、基因家族成员的克隆及特征分析,包括序列比对、基本结构特征、亲缘关系、进化历史等方面;后3个月主要用于基因功能的研究、组织表达分析、基因丝状细胞转化等方面。 在任务进度安排上,要求团队成员密切合作,分配好各项工作,确保任务按时完成。同时,要求每个成员全程参与,积极探讨,保持良好的团队合作精神。 四、参考文献 1.RawatA,ChaudharyKK,ChaturvediP,etal.LongchainfattyacidelongationinJatrophacurcas.Plantsignaling&behavior,2013,8(12):e27469. 2.MietkiewskaE,BrostJM,GiblinEM,etal.IdentificationofcDNAsforjatrophadioxygenase‐relatedenzymesandcloningandexpressionoftheencodedgenes.Lipids,2007,42(6):537-549. 3.XuP,FanJ,RuiY,etal.IdentificationandexpressionanalysisofkeygenesinvolvedinlinolenicacidbiosynthesisinJatrophacurcasL.Industrialcropsandproducts,2020,156:112812. 4.AkbarE,YaakobZ,KamarudinSK,etal.CharacteristicandcompositionofJatrophacurcasoilseedfromMalaysiaanditspotentialasbiodieselfeedstockfeedstock.EuropeanJournalofScientificResearch,2009,29(3):396-403. 5.GuptaPK,HongGL.Miningandanalysisofexpressedsequencetags(ESTs)ofJatrophacurcasfordevelopmentofsimplesequencerepeat(SSR)markers.PlantOmics,2011,4(5):230-235. 免责声明:以上内容仅供参考,不得用于商业或其他非法用途。如有侵权,请及时私信告知。