肠产毒性大肠杆菌检测基因芯片的研制的任务书.docx

肠产毒性大肠杆菌检测基因芯片的研制的任务书
一、研究背景
大肠杆菌作为一种广泛存在于自然界中的细菌，在人类和动物的肠道中具有重要的生理功能。但是，某些菌株可能引起食物中毒，威胁公共卫生安全。一般认为，食物污染是导致食物中毒的主要原因之一，因此控制食品污染是预防食物中毒的关键环节。目前，我国大肠杆菌检测的主要方法还是传统的细菌培养方法，速度慢、精度低、大肠杆菌菌株种类多等问题亟待解决。因此，研发一种快速、准确，能够同时检测多种肠产毒性大肠杆菌菌株的检测方法，对提高食品安全监管的效率具有重要的意义。
二、研究目的
根据我国目前食品安全形势和监管需要，本研究旨在开发一种肠产毒性大肠杆菌检测基因芯片，快速准确地检测食品中的肠产毒性大肠杆菌菌株。并精细探究肠产毒性获得和传播分子机制。
三、研究内容
1.构建肠产毒性大肠杆菌检测基因芯片
(1)选取适合检测肠产毒性大肠杆菌的关键基因。
(2)设计适当的引物并合成基因探针。
(3)对设计的引物、探针进行系统优化，并根据需要进行修饰。
(4)制作肠产毒性大肠杆菌检测基因芯片，并进行验证试验。
2.优化检测方案
(1)优化DNA提取和净化方法，提高检测灵敏度和特异性。
(2)优化PCR检测方案，提高检测准确度。
(3)确定检测界限和检测灵敏度。
3.比较检测效果
(1)将肠产毒性大肠杆菌检测基因芯片与传统的细菌培养法进行比较。
(2)比较两种检测方法的准确度、灵敏度和特异性。
(3)对检测结果进行分析、统计和比较。
4.研究肠产毒性大肠杆菌获得和传播分子机制
(1)分析肠产毒性大肠杆菌获得肠毒素编码基因的机制。
(2)探究肠产毒性大肠杆菌毒力因子的传播机制。
(3)探讨肠产毒性大肠杆菌的毒力变异机制。
四、研究意义
1.提高食品安全监管水平。通过肠产毒性大肠杆菌检测基因芯片，可以快速检测出食品中是否存在肠产毒性大肠杆菌污染，有助于食品监管和减少食品中毒事件发生。
2.提高检测效率和准确性。传统的大肠杆菌检测方法时间较长，同时也存在着很多误差。肠产毒性大肠杆菌检测基因芯片检测方法可以缩短检测时间，提高准确性。
3.拓宽细菌检测领域的研究。肠产毒性大肠杆菌检测基因芯片的研制，将为开展其他微生物细菌种类的基因芯片检测方法提供有益方法和经验。
五、研究进度及预计完成时间
研究总时限：三年
第一年：
(1)在国内外文献基础上，选定检测肠产毒性大肠杆菌的关键基因。
(2)设计引物和合成基因探针。
(3)优化引物、探针。
(4)初步制作肠产毒性大肠杆菌检测基因芯片。
第二年：
(1)优化检测方案，提高检测灵敏度和特异性。
(2)调试PCR检测方案，确定检测灵敏度。
(3)相关生物试验。
第三年：
(1)与传统的细菌培养法进行比较，分析、统计和比较检测结果。
(2)研究肠产毒性大肠杆菌毒力因子的传播机制。
(3)完善研究报告和开展成果推广。
六、研究预算
本研究的总投资为60万元。其中主要预算为人员费用和设备购置费用。
七、研究人员及机构
本研究的研究机构为中国农业科学院农产品质量安全监测与评价研究中心。研究团队由该中心专家和其他有关研究领域专家组成，主要负责研究的内容和任务。研究团队由一名负责人、两名研究骨干和三名实验员组成。