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致泻性大肠杆菌检测基因芯片的研制的综述报告 致泻性大肠杆菌(EnterotoxigenicE.coli,简称ETEC)是一种引起旅游者腹泻和小儿腹泻的常见细菌之一,该菌常通过食物和饮用水传播。由于该菌的检测困难性和代谢特性,传统的分子生物学检测方法比较繁琐并且耗时长,因此需要寻求新的检测方法。 近年来,基于DNA芯片技术的高通量检测技术得到了广泛应用,其具有快速、高效、可靠、灵敏、高通量等优点。本文将综述已有的文献,介绍ETEC检测基因芯片的研制。 ETEC基因芯片的设计思路通常是根据ETEC的相关基因序列设计探针,并结合检测目标基因的特性和序列信息,构建检测芯片。例如,Girard等(2005)基于已知的ETEC毒力因子的序列信息,利用比对算法,从多种ETEC的基因组序列中选择相关区域,构建了一款ETEC毒力检测芯片。该芯片包含了28种ETEC菌株感染时产生的4种重要毒力因子(LT、STa、STb和EAST1)相关的探针。 不同团队的芯片设计方法不同,但其检测原理基本一致,通过获得并封装样品DNA/RNA、探针与样品DNA/RNA的特异性杂交、荧光染色及快速信号检测等步骤,实现快速、准确地检测ETEC的目的。以此类芯片为例,检测基因芯片具有样品处理量低、反应参数可控、高通量、自动化程度高、检测速度快、准确度高等优点。 另外,一些研究者也探索了利用基因芯片技术辅助ETEC毒力调查。例如,Beaujean等(2015)基于大范围的食品样品和ETEC感染样品的基因芯片分析,建立了毒力梳理模型,提出了一个系统的检测框架,可以用于评估肠道性疾病的动态进展、预防和控制。 ETEC检测基因芯片的应用前景广阔,如可用于大规模食品检测、旅游者腹泻的诊断、肠道疾病的调查和监测等领域。由于其优势突出,ETEC基因芯片的开发和应用前景非常广阔。同时,随着新技术和新材料的不断涌现,基于基因芯片技术的ETEC检测芯片得到的进一步突破和发展也已成为必然趋势。