比较基因组学原理及应用学习教案.pptx

会计学比较基因组学相关概念基因组学概念及范畴基因组学概念比较基因组学概念概念部分真核、原核生物基因组成成份分析通过基因组数据进行比较基因组学研究比较基因组有助于解决进化距离问题测序技术与比较基因组学基因组序列分析的计算方法引言点阵图两序列比对Needleman-wunsch全局比对算法多序列比对数据库搜索蛋白质序列分析种内比较基因组学模式生物水产界举例模式生物种间比较基因组学研究
通过对不同亲缘关系物种的基因组序列进行比较，能够鉴定出编码序列、非编码调控序列及给定物种独有的序列。而基因组范围之内的序列比对，可以了解不同物种在核苷酸组成、同线性关系和基因顺序方面的异同，进而得到基因分析预测与定位、生物系统发生进化关系等方面的信息。
比较基因组学的基础是相关生物基因组的相似性。两种具有较近共同祖先的生物，它们之间具有种属差别的基因组是由祖先基因组进化而来，两种生物在进化的阶段上越接近，它们的基因组相关性就越高。如果生物之间存在很近的亲缘关系，那么它们的基因组就会表现出同线性(synteny)，即基因序列的部分或全部保守。可以利用模基因组之间编码顺序上和结构上的同源性，通过已知基因组的作图信息定位另外基因组中的基因，从而揭示基因潜在的功能、阐明物种进化关系及基因组的内在结构。
人类与多个灵长类动物的比较基因组学研究，在阐明灵长类特异基因调节元件和划分多基因的外显子方面显示出了很大的优势。
林木可与拟南芥（已经获得了全基因组序列，一些基因的功能已被注释）和毛果杨等功能基因组研究较深入的物种进行比较基因组学研究，这将为林木上相关基因功能的研究提供便利。生物最本质的特征是进化，比较基因组学同样以进化理论作为理论基石，同时其研究结果又前所未有地丰富和发展了进化理论。
当在两种以上的基因组间进行序列比较时，实质上就得到了序列在系统发生树中的进化关系。基因组信息的增多使得在基因组水平上研究分子进化、基因功能成为可能。Smith-Waterman算法例5：Smith-Waterman算法进行双序列局部比对例5：Smith-Waterman算法进行双序列局部比对Smith-Waterman算法Smith-Waterman算法Smith-Waterman算法Smith-Waterman算法局部比对结果：比较基因组学的应用比较基因组学与进化比较基因组学与进化比较基因组学的具体应用方法和策略比较基因组学研究举例模式生物比较基因组研究特点模式生物基因组的研究模式生物基因组的研究人类基因组基因的三条推测依据模式生物基因组研究对人类基因组研究的促进作用模式生物基因组研究对人类基因组研究的促进作用模式生物基因组研究对人类基因组研究的促进作用结语