蒺藜苜蓿SSR标记遗传图谱的构建及部分农艺性状的QTL定位的任务书.docx

蒺藜苜蓿SSR标记遗传图谱的构建及部分农艺性状的QTL定位的任务书
任务书
任务名称：蒺藜苜蓿SSR标记遗传图谱的构建及部分农艺性状的QTL定位
任务背景：
蒺藜苜蓿是一种优质饲草，广泛分布于全球各地，为畜牧业提供了重要的饲料资源。然而，蒺藜苜蓿在适应环境、产量、品质和耐病性等方面存在一定差异，因此研究其遗传调控机制具有重要意义。SSR标记技术是一种广泛应用的分子标记技术，能够作为构建遗传图谱和定位QTL的有效工具，因此本研究将SSR标记应用于蒺藜苜蓿。
任务目标：
1.构建蒺藜苜蓿SSR标记遗传图谱：利用SSR标记作为分子标记，采用显性标记的AFLP技术构建蒺藜苜蓿遗传图谱。首先，按照基因组DNA的来源，将不同材料的DNA摘出，并提取它们的基因组DNA。接着，采用SSR扩增技术，得到一批SSR标记，然后通过AFLP技术，将这些标记组合得到一个遗传图谱。最后，使用软件对遗传图谱进行分析和处理，得到一个可参考的遗传图谱。
2.蒺藜苜蓿部分农艺性状的QTL定位：通过遗传图谱和相关分子标记，研究蒺藜苜蓿它抗寒、抗旱病体系以及其他农艺性状的QTL空间分布。基于构建的遗传图谱，对蒺藜苜蓿根系生长、发育和农艺性状进行分析，并对QTL位置进行定位分析。最后，通过软件对分析结果进行研究和处理，找到相关QTL序列，探究其作用及机制。
任务步骤：
1.确定SSR标记和分子标记的选取标准，确定目标材料库，进行基因组DNA提取和SSR扩增实验。
2.构建和优化AFLP技术条件，确定AFLP扩增反应的最佳Taq嵌合酶种类和用量，并通过优化AFLP扩增反应体系，筛选代表性的AFLP扩增产物，加以分离、纯化和扩增。
3.将优选的AFLP扩增产物进行特异性的放射性标记，并将标记物与目标DNA样本进行杂交并检测，最终确定标记产物。
4.将标记产物进行数据收集并进行遗传计算、遗传距离和群体分析等处理。
5.将处理后的数据导入软件进行分析和处理，生成蒺藜苜蓿SSR标记遗传图谱。
6.收集和筛选蒺藜苜蓿遗传图谱中相关性状表现突出的个体和特异性表型组合，开展QTL空间位置去定位，在QTL序列中检测并分析QTL相关的基因。
7.将定位好QTL序列，进行功能注释和进化分析，并深入了解QTL的调控机理及其变异机制及其对农业生产的潜在价值。
任务成果：
1.蒺藜苜蓿SSR标记遗传图谱的构建。
2.部分蒺藜苜蓿农艺性状的QTL定位。
3.QTL序列的鉴定和功能注释，以及相应机理分析。
4.课题研究成果的技术报告，研究文献的撰写和提交，以及相关综述性论文的发表。
参考文献：
1.李平泉,陈茜,邱红菊等.中国垂穗蒺藜苜蓿SRAP-SSR融合标记构建和遗传连锁图谱研究[J].作物学报,2015,41(8):1297-1306.
2.张龙,汪莉丽,文云飞等.基于AFLP和SSR标记构建国际黑麦草遗传群体及其遗传多样性分析[J].甘肃农业大学学报,2014,49(3):41-45.
3.周松林,刘春明,王丛丛等.氮剪羊茅的RAPD及ISSR标记分析[J].草业科学,2014,31(3):491-495.